# Training

**URL:** https://community.france-bioinformatique.fr/c/training/25.md

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## [About the Training category](https://community.france-bioinformatique.fr/t/about-the-training-category/2921)

<div class="topic-metadata">

**Author:** [@nc-support](https://community.france-bioinformatique.fr/u/nc-support)\
**Réponses:** 0\
**Dernière mise à jour :** [Avril 6, 2023, 2:21 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/about-the-training-category/2921 "2023-04-06T14:21:20Z")

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This space is dedicated to trainers (their questions for the support team, as well as exchanges between trainers) Cet espace est dédié aux formateurs (leurs questions à l'équipe de support, et les échanges entre format…

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## [Impossible de lancer un RStudio Server: Core](https://community.france-bioinformatique.fr/t/impossible-de-lancer-un-rstudio-server-core/6822)

<div class="topic-metadata">

**Author:** [@drdr](https://community.france-bioinformatique.fr/u/drdr)\
**Réponses:** 2\
**Dernière mise à jour :** [Avril 29, 2026, 9:53 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/impossible-de-lancer-un-rstudio-server-core/6822 "2026-04-29T09:53:03Z")

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Bonjour, Je découvre tout juste les outils mis à disposition par l’IFB. Je cherche à utiliser un cluster pour faire tourner des codes R trop lourds pour mon pc. Cependant quand je lance un cluster j’ai d’abord ce messag…

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## [RTrainer - stuck on "Starting..."](https://community.france-bioinformatique.fr/t/rtrainer-stuck-on-starting/6814)

<div class="topic-metadata">

**Author:** [@cgroeneveld](https://community.france-bioinformatique.fr/u/cgroeneveld)\
**Réponses:** 2\
**Dernière mise à jour :** [Avril 9, 2026, 11:44 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/rtrainer-stuck-on-starting/6814 "2026-04-09T11:44:03Z")

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I’ve been having issues with the OpenOnDemand RTrainer module. After requesting a job, the job gets stuck on “Starting…” and never returns the link to connect and at some point just marks “Completed”. This error seems s…

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## [IFB core account reactivation](https://community.france-bioinformatique.fr/t/ifb-core-account-reactivation/6762)

<div class="topic-metadata">

**Author:** [@syoujilabadi](https://community.france-bioinformatique.fr/u/syoujilabadi)\
**Réponses:** 0\
**Dernière mise à jour :** [Janvier 20, 2026, 8:39 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/ifb-core-account-reactivation/6762 "2026-01-20T20:39:35Z")

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Dear IFB team, I am unable to access my account (syoujilabadi). The web portal indicates that my account is expired. Would it be possible to reactivate it? Thank you! Kind regards, Souad Youjil Abadi

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## [Augmentation temporaire de stockage pour le projet dsapps](https://community.france-bioinformatique.fr/t/augmentation-temporaire-de-stockage-pour-le-projet-dsapps/6737)

<div class="topic-metadata">

**Author:** [@Grace\_Akouvi\_SIKA](https://community.france-bioinformatique.fr/u/Grace_Akouvi_SIKA)\
**Réponses:** 0\
**Dernière mise à jour :** [Novembre 27, 2025, 9:36 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/augmentation-temporaire-de-stockage-pour-le-projet-dsapps/6737 "2025-11-27T09:36:15Z")

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Bonjour ! Serait-il possible d’augmenter temporairement l’espace de stockage de notre projet "dsapps" de 1000 Go à 5 To pendant 1 mois ? Nous allons effectuer plusieurs process qui seront assez lourds en stockage. Après…

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## [Augmenter le stockage a 400-500G](https://community.france-bioinformatique.fr/t/augmenter-le-stockage-a-400-500g/6692)

<div class="topic-metadata">

**Author:** [@Aureliedethonel](https://community.france-bioinformatique.fr/u/Aureliedethonel)\
**Réponses:** 1\
**Dernière mise à jour :** [Septembre 26, 2025, 2:59 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/augmenter-le-stockage-a-400-500g/6692 "2025-09-26T14:59:40Z")

</div>

Bonjour, Je me permets de vous contacter pour demande d'extension de mon stockage à 400-500 Go. J'en ai besoin pour faire processer des études assez lourdes en données et je n'arrive plus a accéder à mon projet sur ond…

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## [Erreur sur ondemand pour un TP (disk quota)](https://community.france-bioinformatique.fr/t/erreur-sur-ondemand-pour-un-tp-disk-quota/6676)

<div class="topic-metadata">

**Author:** [@yguitton](https://community.france-bioinformatique.fr/u/yguitton)\
**Réponses:** 0\
**Dernière mise à jour :** [Septembre 5, 2025, 9:37 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/erreur-sur-ondemand-pour-un-tp-disk-quota/6676 "2025-09-05T09:37:27Z")

</div>

Bonjour, mon espace de cours est sensé être vide et j'ai pourtant une erreur disk quota. Pouvez-vous m'aider? Merci sending incremental file list ./ rsync: recv\_generator: mkdir "/shared/home/yguitton/ondemand/data/…

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## [Pas de lien pour se connecter au Rtrainer](https://community.france-bioinformatique.fr/t/pas-de-lien-pour-se-connecter-au-rtrainer/6585)

<div class="topic-metadata">

**Author:** [@NairaNaouar](https://community.france-bioinformatique.fr/u/NairaNaouar)\
**Réponses:** 0\
**Dernière mise à jour :** [Juillet 3, 2025, 12:37 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/pas-de-lien-pour-se-connecter-au-rtrainer/6585 "2025-07-03T12:37:48Z")

</div>

Bonjour Le lien pour la connection au Rtrainer ne se fait pas. Il reste bloqué à Your session is currently starting... Please be patient as this process can take a few minutes. D'avance merci, Naïra

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## [Obtention des mots de passe TP sur tp\_formation\_ngs\_linux\_166601](https://community.france-bioinformatique.fr/t/obtention-des-mots-de-passe-tp-sur-tp-formation-ngs-linux-166601/6367)

<div class="topic-metadata">

**Author:** [@gbidaut](https://community.france-bioinformatique.fr/u/gbidaut)\
**Réponses:** 1\
**Dernière mise à jour :** [Mai 9, 2025, 11:45 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/obtention-des-mots-de-passe-tp-sur-tp-formation-ngs-linux-166601/6367 "2025-05-09T11:45:54Z")

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Bonjour, Je vais utiliser le projet tp\_formation\_ngs\_linux\_166601 en formation. Pouvez vous m'envoyer les mots de passe associés aux comptes tp SVP ? Merci par avance! Tres bonne journée

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## [Augmenter espace projet Training](https://community.france-bioinformatique.fr/t/augmenter-espace-projet-training/6234)

<div class="topic-metadata">

**Author:** [@patron-michael](https://community.france-bioinformatique.fr/u/patron-michael)\
**Réponses:** 0\
**Dernière mise à jour :** [Mars 25, 2025, 1:55 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/augmenter-espace-projet-training/6234 "2025-03-25T13:55:33Z")

</div>

Bonjour, Est-il possible d'augmenter l'espace du projet tp\_2510\_pfr\_166600 à 1To. Certain des outils et library + les données de test & utilisateurs sur des données ATAC-seq sont volumineux. Merci à vous et bonne journ…

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## [Compte formation CPU limite session R](https://community.france-bioinformatique.fr/t/compte-formation-cpu-limite-session-r/6232)

<div class="topic-metadata">

**Author:** [@patron-michael](https://community.france-bioinformatique.fr/u/patron-michael)\
**Réponses:** 0\
**Dernière mise à jour :** [Mars 25, 2025, 1:14 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/compte-formation-cpu-limite-session-r/6232 "2025-03-25T13:14:10Z")

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Bonjour à vous, Nous sommes sur la formation tp\_2510\_pfr\_166600 et certains utilisateurs sur leurs sessions R ont le message CPU error limit reach. A-t-on atteint la limite ? Il reste encore un jour de formation et l'u…

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## [Formation 2424\_m2\_rennes Package R issue](https://community.france-bioinformatique.fr/t/formation-2424-m2-rennes-package-r-issue/5375)

<div class="topic-metadata">

**Author:** [@yguitton](https://community.france-bioinformatique.fr/u/yguitton)\
**Réponses:** 3\
**Dernière mise à jour :** [Octobre 2, 2024, 7:14 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/formation-2424-m2-rennes-package-r-issue/5375 "2024-10-02T07:14:14Z")

</div>

Bonjour @team.r pour une formation 2424\_m2\_rennes je voudrais que les étudiants installent eux même le package ChemmineOB avec la commande : if (!require("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("BiocManag…

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## [Problème de changement de nom de compte (acount name)](https://community.france-bioinformatique.fr/t/probleme-de-changement-de-nom-de-compte-acount-name/5310)

<div class="topic-metadata">

**Author:** [@Chaymae](https://community.france-bioinformatique.fr/u/Chaymae)\
**Réponses:** 0\
**Dernière mise à jour :** [Septembre 11, 2024, 10:02 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/probleme-de-changement-de-nom-de-compte-acount-name/5310 "2024-09-11T10:02:25Z")

</div>

Je n'arrive pas à changer le nom de compte(demo) (account name)

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## [Creatin de comptes pour une formation](https://community.france-bioinformatique.fr/t/creatin-de-comptes-pour-une-formation/4409)

<div class="topic-metadata">

**Author:** [@VDaric](https://community.france-bioinformatique.fr/u/VDaric)\
**Réponses:** 0\
**Dernière mise à jour :** [Juin 18, 2024, 8:43 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/creatin-de-comptes-pour-une-formation/4409 "2024-06-18T08:43:26Z")

</div>

Bonjour, Je donné une formation d'initiation à Python. Elle aura lieu demain et après demain. Je comptais utiliser JupyterLab ( via https://ondemand.cluster.france-bioinformatique.fr). Plusieurs (au moins 2 sur 12) élè…

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## [Formation IFB sur Marseille](https://community.france-bioinformatique.fr/t/formation-ifb-sur-marseille/4384)

<div class="topic-metadata">

**Author:** [@bballester](https://community.france-bioinformatique.fr/u/bballester)\
**Réponses:** 2\
**Dernière mise à jour :** [Juin 12, 2024, 4:42 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/formation-ifb-sur-marseille/4384 "2024-06-12T04:42:28Z")

</div>

Bonjour, Nous avons créé un réseau de bioinformatique (BIOTIC) dans la région/périmetre d'Aix-Marseille. Ce réseau regroupe à ce jour environ 100 bioinformaticiens.es. Nous avons organisé notre journée d'inauguration en…

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## [Formation 2409\_ubx\_hts](https://community.france-bioinformatique.fr/t/formation-2409-ubx-hts/3948)

<div class="topic-metadata">

**Author:** [@skarkar](https://community.france-bioinformatique.fr/u/skarkar)\
**Réponses:** 4\
**Dernière mise à jour :** [Février 27, 2024, 1:16 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/formation-2409-ubx-hts/3948 "2024-02-27T13:16:14Z")

</div>

Bonjour, Les participants me rapporte de deconnections persistantes sur ler jupyterlab. je leur dit de supprimer le cache des sessions ondemand (repertoire ~/ondemand/) puis de relancer une session, ce qui semble avoir…

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## [Utilisation comptes invités formation](https://community.france-bioinformatique.fr/t/utilisation-comptes-invites-formation/3801)

<div class="topic-metadata">

**Author:** [@daurelle](https://community.france-bioinformatique.fr/u/daurelle)\
**Réponses:** 0\
**Dernière mise à jour :** [Janvier 22, 2024, 12:28 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/utilisation-comptes-invites-formation/3801 "2024-01-22T12:28:57Z")

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Bonjour j'ai fait une demande de comptes invités pour une formation fin février. C'est le projet 2302\_redcoral J'aurais voulu savoir comment utiliser les comptes invités? et au passage peut on augmenter le nombre de co…

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## [Demande d'ouverture de session pour formation FROGS metabarcoding sous galaxy](https://community.france-bioinformatique.fr/t/demande-douverture-de-session-pour-formation-frogs-metabarcoding-sous-galaxy/3421)

<div class="topic-metadata">

**Author:** [@geraldinepascal](https://community.france-bioinformatique.fr/u/geraldinepascal)\
**Réponses:** 4\
**Dernière mise à jour :** [Septembre 21, 2023, 3:56 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/demande-douverture-de-session-pour-formation-frogs-metabarcoding-sous-galaxy/3421 "2023-09-21T15:56:44Z")

</div>

Bonjour @tchaussepied, Exactement dans la même configuration d’avril dernier nous avons prévu une formation FROGS du 9 au 12 octobre prochains – 12 formés et 2 formateurs. Vous n’avez pas de contraintes ou d’interrupti…

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## [Création d'un espace Rstudio pour une classe de master 2?](https://community.france-bioinformatique.fr/t/creation-dun-espace-rstudio-pour-une-classe-de-master-2/3404)

<div class="topic-metadata">

**Author:** [@yguitton](https://community.france-bioinformatique.fr/u/yguitton)\
**Réponses:** 1\
**Dernière mise à jour :** [Septembre 20, 2023, 2:36 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/creation-dun-espace-rstudio-pour-une-classe-de-master-2/3404 "2023-09-20T14:36:36Z")

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Bonjour, Je vais intervenir pour un cours de master 2 et j'aimerais leur faire découvrir Rstudio via le cluster IFB. Est-ce possible de créer un espace pour se cours auquel les étudiants pourraient s'inscrire et ensuite…
