# Latest **URL:** https://community.france-bioinformatique.fr/latest.md [Récents](https://community.france-bioinformatique.fr/latest.md) · [Catégories](https://community.france-bioinformatique.fr/categories.md) · [Étiquettes](https://community.france-bioinformatique.fr/tags.md) --- ## [Formation en cours: Jobs qui ne se terminent pas](https://community.france-bioinformatique.fr/t/formation-en-cours-jobs-qui-ne-se-terminent-pas/6892)
**Author:** [@slegras](https://community.france-bioinformatique.fr/u/slegras)\ **Réponses:** 1\ **Dernière mise à jour :** [Septembre 28, 2026, 11:18 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/formation-en-cours-jobs-qui-ne-se-terminent-pas/6892 "2026-09-28T11:18:56Z")
Bonjour, Nous avons une formation en cours à l'heure actuelle (du 28 au 30 Septembre ; ngs-stras-cnrs-2026) et les jobs qui sont sensés se terminer très rapidement (outil falco) ne le sont toujours pas. Pourriez vous r… --- ## [Arrêt de l'infrastructure IFB Core Cluster du 14 au 21 septembre 2026](https://community.france-bioinformatique.fr/t/arret-de-linfrastructure-ifb-core-cluster-du-14-au-21-septembre-2026/6872)
**Author:** [@nc-support](https://community.france-bioinformatique.fr/u/nc-support)\ **Réponses:** 1\ **Dernière mise à jour :** [Septembre 21, 2026, 2:45 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/arret-de-linfrastructure-ifb-core-cluster-du-14-au-21-septembre-2026/6872 "2026-09-21T14:45:00Z")
:france: Chers utilisateur.rice.s du cluster IFB Core, Notre hébergeur l’IDRIS effectue un arrêt électrique le 15 septembre 2026 et toute l'infrastructure IFB Core Cluster sera arrêtée du 14 au 21 septembre 2026. Lun… --- ## [Batch\_correction error](https://community.france-bioinformatique.fr/t/batch-correction-error/5625)
**Author:** [@tco22](https://community.france-bioinformatique.fr/u/tco22)\ **Réponses:** 6\ **Dernière mise à jour :** [Septembre 9, 2026, 3:44 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/batch-correction-error/5625 "2026-09-09T15:44:56Z")
Hi W4M team, I have this issue when running the 'batch\_correction' module (v3.0.0) on usegalaxy.eu: It is important to notice that on this specific test, I am working only with QC pool, and I have not included my sa… --- ## [Mémoire allouée](https://community.france-bioinformatique.fr/t/memoire-allouee/6885)
**Author:** [@cel](https://community.france-bioinformatique.fr/u/cel)\ **Réponses:** 4\ **Dernière mise à jour :** [Septembre 7, 2026, 3:16 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/memoire-allouee/6885 "2026-09-07T15:16:06Z")
Bonjour, Je mets actuellement à jour une formation lors de laquelle je souhaiterais utiliser l’outil « Convert GTF to BED12 ». Cependant avec la version d’annotations que je souhaite utiliser (GTF d’Ensembl 116) j’obtie… --- ## [Demande d'installation de RGI card](https://community.france-bioinformatique.fr/t/demande-dinstallation-de-rgi-card/6886)
**Author:** [@fmareuil](https://community.france-bioinformatique.fr/u/fmareuil)\ **Réponses:** 2\ **Dernière mise à jour :** [Septembre 7, 2026, 2:16 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/demande-dinstallation-de-rgi-card/6886 "2026-09-07T14:16:30Z")
Bonjour, Est ce que ça serait possible d'installer l'outil RGI card ? Galaxy Tool Shed Merci d'avance, Fabien --- ## [Connexion ssh impossible ce jour](https://community.france-bioinformatique.fr/t/connexion-ssh-impossible-ce-jour/6880)
**Author:** [@Claudel\_Alexis](https://community.france-bioinformatique.fr/u/Claudel_Alexis)\ **Réponses:** 5\ **Dernière mise à jour :** [Août 24, 2026, 9:30 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/connexion-ssh-impossible-ce-jour/6880 "2026-08-24T09:30:47Z")
Bonjour j'ai du mal à me connecter en ssh ce jour... est-ce normal ?? Merci, aclaudel --- ## [Extension de la capacité de stockage](https://community.france-bioinformatique.fr/t/extension-de-la-capacite-de-stockage/6863)
**Author:** [@Yosra](https://community.france-bioinformatique.fr/u/Yosra)\ **Réponses:** 3\ **Dernière mise à jour :** [Août 24, 2026, 8:23 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/extension-de-la-capacite-de-stockage/6863 "2026-08-24T08:23:08Z")
Bonjour, J'ai un grand set de données en MSMS, j'ai supprimé mes anciens historiques mais toujours pas assez, pourrai je vous demander d'augmenter ma capacité à 200 pour les prochaines 6 mois? Merci --- ## [Troubleshooting - XCMS](https://community.france-bioinformatique.fr/t/troubleshooting-xcms/6883)
**Author:** [@melpetera](https://community.france-bioinformatique.fr/u/melpetera)\ **Réponses:** 1\ **Dernière mise à jour :** [Août 21, 2026, 3:26 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/troubleshooting-xcms/6883 "2026-08-21T15:26:49Z")
This topic is dedicated to tips concerning the XCMS Galaxy tool suit, that may help you while performing analyses with Workflow4Metabolomics. Do not hesitate to glance over it, in particular prior to any help request con… --- ## [Problème Galaxy?](https://community.france-bioinformatique.fr/t/probleme-galaxy/6874)
**Author:** [@GabryelleAgoutin](https://community.france-bioinformatique.fr/u/GabryelleAgoutin)\ **Réponses:** 4\ **Dernière mise à jour :** [Août 3, 2026, 7:55 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/probleme-galaxy/6874 "2026-08-03T07:55:26Z")
Bonjour @team.galaxy J'ai un de mes collègues qui me dit qu'il a essayé plusieurs fois de lancer les analyses sur galaxy IFB mais qu'il est tout le temps « queued » même après une nuit et même quand il relance. J'ai aus… --- ## [Fillchrompeaks-parameters](https://community.france-bioinformatique.fr/t/fillchrompeaks-parameters/3425)
**Author:** [@tco22](https://community.france-bioinformatique.fr/u/tco22)\ **Réponses:** 4\ **Dernière mise à jour :** [Juillet 30, 2026, 9:19 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/fillchrompeaks-parameters/3425 "2026-07-30T09:19:42Z")
Hi W4M team, I am using Galaxy pipeline and the tool xcms\_fillpeaks (fillChromPeaks) for LC-HRMS dataset. however, I was wondering why we can't choose the argument 'param', which is feasible in the xcms function. Here … --- ## [Failed to activate conda environment!](https://community.france-bioinformatique.fr/t/failed-to-activate-conda-environment/6873)
**Author:** [@amousset01](https://community.france-bioinformatique.fr/u/amousset01)\ **Réponses:** 0\ **Dernière mise à jour :** [Juillet 29, 2026, 8:42 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/failed-to-activate-conda-environment/6873 "2026-07-29T08:42:35Z")
Bonjour, depuis la semaine dernière lorsque nous lançons nos workflows, 2 erreurs apparaissent sur certaines données. Nous avons relancé plusieurs fois, une de ces erreurs fait planter le workflow à chaque fois mais pas … --- ## [Job galaxy tournant dans le vide](https://community.france-bioinformatique.fr/t/job-galaxy-tournant-dans-le-vide/6842)
**Author:** [@cmigne](https://community.france-bioinformatique.fr/u/cmigne)\ **Réponses:** 19\ **Dernière mise à jour :** [Juillet 21, 2026, 12:55 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/job-galaxy-tournant-dans-le-vide/6842 "2026-07-21T12:55:58Z")
Bonjour, j'ai lancé des analyses lundi qui normalement tournent assez rapidement (moins de 10 min/fichier de la dataset collection). En consultant mon historique aujourd'hui, cela tourne encore: Cela ne vient pas des… --- ## [Problème upload Galaxy france](https://community.france-bioinformatique.fr/t/probleme-upload-galaxy-france/6870)
**Author:** [@Baliarda](https://community.france-bioinformatique.fr/u/Baliarda)\ **Réponses:** 3\ **Dernière mise à jour :** [Juillet 21, 2026, 7:27 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/probleme-upload-galaxy-france/6870 "2026-07-21T07:27:33Z")
Bonjour, J'essaie de charger une archive tar depuis ce matin et elle est toujours dans la queue de téléchargement. Rencontrez-vous un souci technique aujourd'hui? Merci d'avance --- ## [Conda dependency](https://community.france-bioinformatique.fr/t/conda-dependency/6866)
**Author:** [@mtremblayfranco](https://community.france-bioinformatique.fr/u/mtremblayfranco)\ **Réponses:** 0\ **Dernière mise à jour :** [Juillet 16, 2026, 12:51 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/conda-dependency/6866 "2026-07-16T12:51:53Z")
Bonjour, Nous avons mis à jour les outils nmr\_Read' (version 3.4.0+galaxy2, id 'toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/marie-tremblay-metatoul/nmr\_preprocessing/NMR\_Read/3.4.0+galaxy2') et 'NMR\_Preprocessing' (version 3.4.0+galax… --- ## [Pbl fonctionnement Galaxy](https://community.france-bioinformatique.fr/t/pbl-fonctionnement-galaxy/6860)
**Author:** [@mlagree](https://community.france-bioinformatique.fr/u/mlagree)\ **Réponses:** 6\ **Dernière mise à jour :** [Juillet 15, 2026, 9:31 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/pbl-fonctionnement-galaxy/6860 "2026-07-15T09:31:26Z")
Bonjour, je n'arrive plus à exécuter de jobs sous Galaxy. Les jobs restent bloqués en "pause" depuis hier après-midi. Auriez-vous une solution pour me débloquer svp? Merci par avance Marie --- ## [Mes job ne s'executent pas](https://community.france-bioinformatique.fr/t/mes-job-ne-sexecutent-pas/6861)
**Author:** [@dcenteno](https://community.france-bioinformatique.fr/u/dcenteno)\ **Réponses:** 2\ **Dernière mise à jour :** [Juillet 15, 2026, 7:04 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/mes-job-ne-sexecutent-pas/6861 "2026-07-15T07:04:01Z")
Bonjour, Bonjour, Suite à la maintenance de mercredi, mes jobs ne s’exécutent plus : ils sont en attente depuis hier matin. Pourriez-vous me confirmer si je suis simplement en file d’attente ou s’il y a un autre problè… --- ## [Demande de plus d'espace](https://community.france-bioinformatique.fr/t/demande-de-plus-despace/6862)
**Author:** [@myriam.mazouza](https://community.france-bioinformatique.fr/u/myriam.mazouza)\ **Réponses:** 0\ **Dernière mise à jour :** [Juillet 10, 2026, 7:25 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/demande-de-plus-despace/6862 "2026-07-10T07:25:49Z")
Bonjour, j'ai plusieurs projets à traiter en même temps, serait il possible d'avoir plus d'espace dans mon compte s'il vous plait ? --- ## [Augmentation d'espace disque](https://community.france-bioinformatique.fr/t/augmentation-despace-disque/6857)
**Author:** [@dcenteno](https://community.france-bioinformatique.fr/u/dcenteno)\ **Réponses:** 1\ **Dernière mise à jour :** [Juillet 8, 2026, 9:15 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/augmentation-despace-disque/6857 "2026-07-08T09:15:42Z")
Bonjour, Serait-il possible d'augmenter mon espace de disque Galaxy à 350 GB pour des projets qui vont arriver mi août avec un nombre assez importants de data svp ? D'avance merci Cordialement, --- ## [Demande : augmentation espace disque](https://community.france-bioinformatique.fr/t/demande-augmentation-espace-disque/6856)
**Author:** [@cTALLEU](https://community.france-bioinformatique.fr/u/cTALLEU)\ **Réponses:** 1\ **Dernière mise à jour :** [Juillet 8, 2026, 9:13 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/demande-augmentation-espace-disque/6856 "2026-07-08T09:13:39Z")
Bonjour, Est-il possible d'augmenter provisoirement mon espace de disque Galaxy à 500 GB afin que je puisse terminer l'analyse des séquences de mon projet de thèse ? Bien à vous. --- ## [Galaxy history graph view](https://community.france-bioinformatique.fr/t/galaxy-history-graph-view/6851)
**Author:** [@etiennejls](https://community.france-bioinformatique.fr/u/etiennejls)\ **Réponses:** 1\ **Dernière mise à jour :** [Juillet 8, 2026, 7:57 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/galaxy-history-graph-view/6851 "2026-07-08T07:57:08Z")
En assistant à la GCC la semaine dernière, j'ai appris l'existence de la fonctionnalité de vue en forme de graphe des historiques galaxy. Cette fonctionnalité est déjà active sur usegalaxy.eu et je me demandais quand ell… --- ## [Mise a disposition de nouvelles banques pour FROGS](https://community.france-bioinformatique.fr/t/mise-a-disposition-de-nouvelles-banques-pour-frogs/3454)
**Author:** [@geraldinepascal](https://community.france-bioinformatique.fr/u/geraldinepascal)\ **Réponses:** 61\ **Dernière mise à jour :** [Juillet 6, 2026, 2:00 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/mise-a-disposition-de-nouvelles-banques-pour-frogs/3454 "2026-07-06T14:00:58Z")
Bonjour, Pourriez-vous intégrer à l’outil FROGS 4.1 Taxonomic affiliation, les banques de données http://genoweb.toulouse.inra.fr/frogs\_databanks/assignation/GTDB/16S-ITS-23S-DB\_GTDB\_08-RS214.tar.gz http://genoweb.tou… --- ## [Pb de Job qui ne se s'executent pas](https://community.france-bioinformatique.fr/t/pb-de-job-qui-ne-se-sexecutent-pas/6853)
**Author:** [@dcenteno](https://community.france-bioinformatique.fr/u/dcenteno)\ **Réponses:** 2\ **Dernière mise à jour :** [Juillet 3, 2026, 7:39 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/pb-de-job-qui-ne-se-sexecutent-pas/6853 "2026-07-03T07:39:36Z")
Bonjour, Depuis ce midi, mes jobs restent en pause sans reprendre leur exécution. Je constate par ailleurs que ce type de dysfonctionnement devient de plus en plus fréquent et impacte fortement nos délais de traitement… --- ## [Chargement de data en pause depuis 2 jours](https://community.france-bioinformatique.fr/t/chargement-de-data-en-pause-depuis-2-jours/6839)
**Author:** [@dcenteno](https://community.france-bioinformatique.fr/u/dcenteno)\ **Réponses:** 2\ **Dernière mise à jour :** [Juin 19, 2026, 9:18 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/chargement-de-data-en-pause-depuis-2-jours/6839 "2026-06-19T09:18:18Z")
J'ai un projet dans lequel je charge mes données mais une partie reste en pause. Pourriez-vous m'indiquer quel est le problème ? --- ## [Demande d'augmentation de stockage galaxy](https://community.france-bioinformatique.fr/t/demande-daugmentation-de-stockage-galaxy/6847)
**Author:** [@vs-bacvir-t5](https://community.france-bioinformatique.fr/u/vs-bacvir-t5)\ **Réponses:** 1\ **Dernière mise à jour :** [Juin 19, 2026, 9:14 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/demande-daugmentation-de-stockage-galaxy/6847 "2026-06-19T09:14:02Z")
bonjour, j'ai récemment reçu des résultats de transcriptomique que je souhaite traiter sur galaxy. Ayant près de 150Go de fichiers à traiter, serait-il possible d'augmenter l'espace de stockage à 1To pour environs 6 moi… --- ## [Request for increased storage space on Galaxy](https://community.france-bioinformatique.fr/t/request-for-increased-storage-space-on-galaxy/6850)
**Author:** [@Yasmine](https://community.france-bioinformatique.fr/u/Yasmine)\ **Réponses:** 1\ **Dernière mise à jour :** [Juin 19, 2026, 9:10 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/request-for-increased-storage-space-on-galaxy/6850 "2026-06-19T09:10:16Z")
Dear IFB support, I am running an RNA-Seq pipeline using HISAT2 and DESeq2. My raw dataset size has caused me to hit my 100 GB limit. Could I please request a temporary quota extension to 250 GB (or 500 GB) for the next… --- ## [Stockage supplémentaire de 500 Go](https://community.france-bioinformatique.fr/t/stockage-supplementaire-de-500-go/6849)
**Author:** [@icaldea](https://community.france-bioinformatique.fr/u/icaldea)\ **Réponses:** 1\ **Dernière mise à jour :** [Juin 19, 2026, 9:01 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/stockage-supplementaire-de-500-go/6849 "2026-06-19T09:01:46Z")
Bonjour, Je suis en train d'analyser un jeu de données de transcriptomiques très lourds et j'aurais besoin d'au moins 500 Go de façon transitoire, svp. D'avance je vous remercie Isabelle Caldelari --- ## [Espace de stockage supplémentaire possible?](https://community.france-bioinformatique.fr/t/espace-de-stockage-supplementaire-possible/6848)
**Author:** [@m.rey](https://community.france-bioinformatique.fr/u/m.rey)\ **Réponses:** 0\ **Dernière mise à jour :** [Juin 16, 2026, 3:11 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/espace-de-stockage-supplementaire-possible/6848 "2026-06-16T15:11:35Z")
Bonjour, Malgré un gros tri dans mes historiques W4M récemment, je suis sur plusieurs projets en même temps et arrive en limite de stockage. Serait-il possible d'augmenter mon espace de stockage à 250 ou 300 Mo, pour 6… --- ## [Nextdenovo l'enfer!](https://community.france-bioinformatique.fr/t/nextdenovo-lenfer/6846)
**Author:** [@julieOrjuela](https://community.france-bioinformatique.fr/u/julieOrjuela)\ **Réponses:** 0\ **Dernière mise à jour :** [Juin 15, 2026, 12:53 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/nextdenovo-lenfer/6846 "2026-06-15T12:53:39Z")
Bonjour, est-ce que vous avez déjà eu à utiliser nexdenovo :smiling\_face\_with\_tear: ? Je suis en dépression :face\_with\_peeking\_eye: avec cette outil qui pour l'assemblage suggère une étape de correction de reads. Seul b… --- ## [Fail to submit R session OnDemand](https://community.france-bioinformatique.fr/t/fail-to-submit-r-session-ondemand/6838)
**Author:** [@pkyratzi](https://community.france-bioinformatique.fr/u/pkyratzi)\ **Réponses:** 1\ **Dernière mise à jour :** [Mai 26, 2026, 11:31 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/fail-to-submit-r-session-ondemand/6838 "2026-05-26T11:31:46Z")
Hi, I am trying to submit an R session through OnDemand, but I receive the following error message: Failed to stage the template with the following error: Disk quota exceeded @ dir\_s\_mkdir - /shared/home/pkyratzi/onde… --- ## [Problem to use the Busco tool with odb12 for Eukaryotes lineage](https://community.france-bioinformatique.fr/t/problem-to-use-the-busco-tool-with-odb12-for-eukaryotes-lineage/6836)
**Author:** [@Silke\_Jensen](https://community.france-bioinformatique.fr/u/Silke_Jensen)\ **Réponses:** 0\ **Dernière mise à jour :** [Mai 5, 2026, 7:46 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/problem-to-use-the-busco-tool-with-odb12-for-eukaryotes-lineage/6836 "2026-05-05T19:46:01Z")
Hi, I wanted to use the odb12 database for the Eukaryotes lineage for Busco analyses of my genome assemblies (tool Busco Assess genome assembly and annotation completeness(Galaxy Version 5.8.0+galaxy2)). I didn't manage… [Page suivante](https://community.france-bioinformatique.fr/latest.md?page=1)