Accès à la partition bigmem

Bonjour,
J'aurais besoin de pouvoir accéder à la partition bigmem pour faire tourner une analyse mmseq gourmande en ram.
Et t'il possible d'y avoir accès ?

Merci par avance,

cordialement,

Thomasptt.

Bonjour Thomas,

Avez-vous pu tester en réservant un nœud standard qui fournit quand même 256Go RAM (option --exclusive) ou en spécifiant la mémoire utile (--mem=250G par exemple) ?
Avant de donner l'accès à la machine dite bigmem, on préfère s'assurer que c'est bien la mémoire qui est limitante.

Nous restons à disposition pour en discuter.

Bonjour,

Le projet que je souhaite réalisé utilise MMSEQS et SPADES, avec un très large jeu de données. Ce traitement va avoir des demandes en RAM qui dépasse les 500G et je ne pourrai malheureusement pas utiliser le nœud standard pour cette opération.

Merci de votre compréhension.

Cordialement.

Thomasptt

Bonjour Thomas,

Vous avez maintenant accès à la partition bigmem.
Pensez simplement à le demander explicitement:

#SBATCH --partition bigmem

Faites-nous signe en cas de problème

Bonne fin de journée