Accès Cluster Down

lucie
qu'est ce qui se passe
covid-19 n'attaque pas les serveurs normalement
moi qui commencait le teletravail le vendredi......

Bonjour à toutes et tous.
Avez vous des soucis de connection au cluster en ssh et à rstudio? c'est kaput de chez moi.
biz distancielle
Olivier

l'acces ssh au cluster est revenu. :+1: :+1:

Bonjour Olivier,

On constate toujours des anomalies... On continue à surveiller/analyser.

Bonjour
j'essaie d'uploader des gros fastq (~5Go chacun) via scp et je perds régulièrement la connexion. Du coup je relance encore et encore... Peut-être n'est-ce pas la meilleure façon de procéder? Merci de votre aide!

Magali

Bonjour,

L'accès au cluster est stable de nouveau. On soupçonne une charge sur le cluster créant des ralentissements/blocages temporaire.

On continue à surveiller. Désolé du désagrément.

@Mag scp devrait à nouveau bien fonctionner (les déconnexions ne sont pas dû à scp). Pour des petits transferts il fonctionne très bien. Pour les transferts plus gros ou avec de nombreux fichiers, je conseille plutôt d'utiliser rsync (https://ifb-elixirfr.gitlab.io/cluster/doc/data/#transfer). rsync a le gros avantage de faire de la "reprise de transfert". On peut alors relancer plusieurs fois (après des coupures ou simplement pour s'assurer que tout a bien été transféré) et rsync ne transfère que les fichiers modifiés (ou partiellement copiés).

Bonne fin d'après-midi

Merci beaucoup! Mon transfert s'est finalement effectué très rapidement et sans soucis.

D'une manière générale, depuis 2 jours, le cluster IFB Core s'est trouvé très ralenti.
Nous avons identifié le problème et tout semble de nouveau disponible.

A long terme, nous sommes en train de finaliser l'achat d'une nouvelle infrastructure de stockage plus performante qui devrait résoudre ces soucis relativement récurrent.

Merci à tous de votre patience.

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Merci à toute l'équipe pour l'efficacité, la communication et la pédagogie.

Bonne journée,

LK

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