Bonjour,
Je souhaiterais lancer deux co-assemblages de Metagenomes en utilisant l’outil MetaSPADES : https://github.com/ablab/spades#meta . Cela demande beaucoup de Ram et va prendre quelque temps (entre une semaine et un mois…). Pourrais-je, s’il vous plaît, avoir accès à bigmem et savoir comment avoir MetaSPADES sur le cluster ? Je ne le trouve pas dans les modules disponibles
Merci beaucoup pour votre aide,
Feriel
Bonjour Feriel,
Désolée du retard de notre réponse.
La version 3.14.1 de spades (https://anaconda.org/bioconda/spades) est installée.
Est ce que cela conviendrait ?
Bonne journée
Nicole
Bonjour,
Oui c'est parfait! Merci
Puis-je lancer mon assemblage ?
Bonne journée,
Feriel
Bonjour Feriel
Oui vous avez acces à bigmem.
Dites nous quand vous n'aurez plus besoin de cet accès.
Bonne journée
Nicole
J'ajoute que le cluster sera éteint le 23 Mars 2021. Il faut donc que vos calculs aboutissent avant cette date.
Trés bien merci beaucoup
Bonne journée,
Feriel