Bonjour
Je souhaite télécharger des données de RNAseq à partir de la base de donnée EGA, mais je n'arrive pas à me connecter car à priori il faut une ouverture de port 8443 d'après le message d'erreur.
Voici ce que j'ai fait à partir de leur tuto : https://github.com/EGA-archive/ega-download-client
#####################
conda create --name EGA
conda init bash
exit
conda activate EGA
conda install pyega3
y
nano credentials.json
{
"username": "isabelle.girault@ose-immuno.com",
"password": "xxxx"
}
to list the datasets
pyega3 -cf credentials.json datasets
Et voici le message d'erreur :
"requests.exceptions.ConnectionError: HTTPSConnectionPool(host='ega.ebi.ac.uk', port=8443): Max retries exceeded with url: /ega-openid-connect-server/token (Caused by NewConnectionError('<urllib3.connection.HTTPSConnection object at 0x7f1b521e1bb0>: Failed to establish a new connection: [Errno 110] Connection timed out'))"
Est ce que qq'un connait l amarche à suivre svp
Merci de votre aide
Isabelle