Demande Accès partition Bigmem

Bonjour,

Je traite actuellement des données métagénomiques et il arrive fréquemment que mes logiciels plantent sur certaines étapes particulièrement gourmandes en RAM (avec la mémoire fixée à 250G) et me retourne cette erreur :
"slurmstepd: error: Detected 1 oom-kill event(s) in step 15223830.batch cgroup. Some of your processes may have been killed by the cgroup out-of-memory handler".

Serait il possible de m'accorder un accès à la partition bigmem afin que je puisse y faire tourner mes programmes les plus volumineux ?

Mon projet : oran_lake_meta
Mon identifiant : thboyer

Je vous souhaite une bonne journée,

Théophile B

Bonjour,

C'est fait, normalement c'est temporaire, merci de nous indiquer quand vous n'en avez plus besoins.

Pensez a préciser la partition quand vous utilisez srun:

srun --partition=bigmem 

Merci beaucoup ! Je vous tiendrais au courant lorsque je n'en aurai plus besoin.

je vous souhaite une bonne journée,

Théophile

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Bonjour.
Je souhaiterai acceder a bigmem (projet germlinegene), j'ai eu des OUT_OF_MEM sur la partition fast. Ca ne devrait pas etre trop long.
merciiii
Olivier

Bonjour Olivier,

C'est fait. Pensez à spécifier a partition et le projet ( --partition=bigmem --account=germlinegene).

Bonne journée