# Demande installation ReLERNN et accès noeud GPU

**URL:** <https://community.france-bioinformatique.fr/t/demande-installation-relernn-et-acces-noeud-gpu/3586>\
**Category:** Tool or data bank request\
**Tags:** python\
**Created:** [Novembre 6, 2023, 12:22 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/demande-installation-relernn-et-acces-noeud-gpu/3586 "2023-11-06T12:22:08Z")\
**Posts on this page:** 3\
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**Author:** ![msalson](https://community.france-bioinformatique.fr/letter_avatar_proxy/v4/letter/m/87869e/32.png) [@msalson](https://community.france-bioinformatique.fr/u/msalson)\
**Post date:** [Novembre 6, 2023, 12:22 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/demande-installation-relernn-et-acces-noeud-gpu/3586/1 "2023-11-06T12:22:08Z")

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Bonjour,

Serait-il possible d'installer l'outil ReLERNN ([GitHub - kr-colab/ReLERNN: Recombination Landscape Estimation using Recurrent Neural Networks](https://github.com/kr-colab/ReLERNN)) qui nécessite un noeud GPU ?

J'aimerais également demander l'accès aux noeuds GPU (nom d'utilisateur: msalson et projet snp\_calling\_gatk\_mil)

Merci beaucoup pour votre aide et bonne journée,

Marine

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**Author:** ![dbenaben](https://community.france-bioinformatique.fr/user_avatar/community.france-bioinformatique.fr/dbenaben/32/43_2.png) [@dbenaben](https://community.france-bioinformatique.fr/u/dbenaben)\
**Post date:** [Novembre 7, 2023, 7:59 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/demande-installation-relernn-et-acces-noeud-gpu/3586/2 "2023-11-07T07:59:12Z")

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Bonjour Marine,

Vous avez maintenant accès au GPU pour vote projet.  
N'oubliez pas de spécifier la partition (`--partition=gpu`), votre compte (`--account=<votre-projet>`) et pensez à vérifier le bon usage des ressources ([https://ifb-elixirfr.gitlab.io/cluster/doc/troubleshooting/#slurm-how-to-use-resources-wisely](https://ifb-elixirfr.gitlab.io/cluster/doc/troubleshooting/#slurm-how-to-use-resources-wisely)

Pour utiliser l'outil ReLERNN, le plus simple me semble de charger le module python (qui vient avec `tensorflow` et tout un tas de librairies) et d'installer l'outil comme indiqué ([https://github.com/kr-colab/ReLERNN#recommended-installation-on-linux](https://github.com/kr-colab/ReLERNN#recommended-installation-on-linux)). Quelque chose comme:

```auto
module load python/3.9
git clone https://github.com/kr-colab/ReLERNN.git
cd ReLERNN
pip install .

```

Dites-nous si c'est bon pour vous.

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**Author:** ![msalson](https://community.france-bioinformatique.fr/letter_avatar_proxy/v4/letter/m/87869e/32.png) [@msalson](https://community.france-bioinformatique.fr/u/msalson)\
**Post date:** [Novembre 7, 2023, 9:18 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/demande-installation-relernn-et-acces-noeud-gpu/3586/3 "2023-11-07T09:18:56Z")

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Bonjour,

Merci beaucoup pour le doit d'accès.

D'accord je vais essayer de faire comme ça pour l'outil.

Merci beaucoup encore et bonne journée,

Marine