Demande Logiciels Binning

Bonjour,

J'aurai besoin de réalisé du binning sur mes contigs obtenues avec via des assemblages métagenomiques. J'ai besoin d'effectuer un comparatif afin de savoir lequel conviendrait le mieux pour mes données j'en ai donc sélectionné deux :

Vamb : https://anaconda.org/bioconda/vamb / https://github.com/RasmussenLab/vamb

Metawatt : https://anaconda.org/bioconda/metawatt / https://sourceforge.net/projects/metawatt/

Enfin il me faut un logiciel pour m'assurer de leur qualité et les comparer :

CheckM : https://anaconda.org/bioconda/checkm-genome / https://github.com/Ecogenomics/CheckM/wiki/Installation#how-to-install-checkm

Serait-il possible que vous les installiez tous les trois sur le serveur ? je vous ai mis les liens bioconda et github en fonction de votre préférence.

Je vous remercie de votre aide et vous souhaite une bonne journée ! :slight_smile:

Théophile B.

Bonjour,

Installation en cours ici: