# Dorado/0.9.0 & gpu-node-02: Failed to initialize NVML: Driver/library version mismatch

**URL:** <https://community.france-bioinformatique.fr/t/dorado-0-9-0-gpu-node-02-failed-to-initialize-nvml-driver-library-version-mismatch/6421>\
**Category:** IFB Core Cluster\
**Tags:** slurm\
**Created:** [Mai 17, 2025, 7:43 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/dorado-0-9-0-gpu-node-02-failed-to-initialize-nvml-driver-library-version-mismatch/6421 "2025-05-17T07:43:15Z")\
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**Author:** ![vlibis](https://community.france-bioinformatique.fr/letter_avatar_proxy/v4/letter/v/958977/32.png) [@vlibis](https://community.france-bioinformatique.fr/u/vlibis)\
**Post date:** [Mai 17, 2025, 7:43 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/dorado-0-9-0-gpu-node-02-failed-to-initialize-nvml-driver-library-version-mismatch/6421/1 "2025-05-17T07:43:15Z")

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Bonjour,

Je rencontre des difficultés à utiliser la partition **gpu-node-02** avec le module dorado/0.9.0 (pour du basecalling de données de séquençage nanopore) : dorado semble échouer à trouver la carte GPU.

Message d'erreur de dorado dans les logs de SLURM :

```auto
[2025-05-17 09:25:12.797] [warning] Failed to initialize NVML: Driver/library version mismatch, retrying in 1s...
[2025-05-17 09:25:13.797] [warning] Failed to initialize NVML after 10 seconds: Driver/library version mismatch
[2025-05-17 09:25:13.797] [warning] CUDA_VISIBLE_DEVICES contains more device ids (1) than devices found by NVML (0).
[2025-05-17 09:25:13.797] [error] Invalid CUDA device index '0' from device string "cuda:0", there are 0 visible CUDA devices.

```

Cela ressemble à un problème d'installation du driver nvidia. J'ai testé avec deux profiles dans un script que je lance avec sbatch `#SBATCH --gres=gpu:7g.40gb:1` et `#SBATCH --gres=gpu:3g.20gb:1`. J'ai un test en cours sur un autre noeud GPU (dans la queue).

Je pense que [ce sujet](https://stackoverflow.com/questions/43022843/nvidia-nvml-driver-library-version-mismatch) sur stackoverflow est pertinent.

Qu'en pensez-vous ?

Merci, bien à vous,

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**Author:** ![vlibis](https://community.france-bioinformatique.fr/letter_avatar_proxy/v4/letter/v/958977/32.png) [@vlibis](https://community.france-bioinformatique.fr/u/vlibis)\
**Post date:** [Mai 17, 2025, 11:43 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/dorado-0-9-0-gpu-node-02-failed-to-initialize-nvml-driver-library-version-mismatch/6421/2 "2025-05-17T11:43:28Z")

</div>

Le problème semble ne pas affecter **gpu-node-03**.