# Erreur avec le tool withinvariation provenant du toolshed

**URL:** <https://community.france-bioinformatique.fr/t/erreur-avec-le-tool-withinvariation-provenant-du-toolshed/1005>\
**Category:** bio.tools\
**Created:** [Février 18, 2021, 7:59 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/erreur-avec-le-tool-withinvariation-provenant-du-toolshed/1005 "2021-02-18T07:59:29Z")\
**Posts on this page:** 2\
**Page:** 1

<div class="post-metadata">

**Author:** ![annel](https://community.france-bioinformatique.fr/letter_avatar_proxy/v4/letter/a/b77776/32.png) [@annel](https://community.france-bioinformatique.fr/u/annel)\
**Post date:** [Février 18, 2021, 7:59 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/erreur-avec-le-tool-withinvariation-provenant-du-toolshed/1005/1 "2021-02-18T07:59:29Z")

</div>

Bonjour,  
J'ai trouvé cet outil qui correspond aux besoins du projet que je porte sous GalaxyProject.  
Après l’installation du tool, j’ai voulu le tester avec les données « test-data » en suivant ce qui est indiqué dans la section du fichier xml et j’ai un message d’erreur sur les outputs :

- Fatal error: Exit code 134 ()
- terminate called after throwing an instance of 'std::runtime\_error'  
what(): Mutex creation failed  
/srv/galaxy/jobs/000/174/tool\_script.sh : ligne 60 : 4293 Abandon (core dumped) Rscript /srv/galaxy/var/shed\_tools/toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/yguitton/withinvariation/5086ad0c0992/withinvariation/withinvariation-26603602a823/mixomics\_multilevel.r dataMatrix\_in "/data/000/dataset\_216.dat" sampleMetadata\_in "/data/000/dataset\_217.dat" repmeasure "Subject" transfo "none" respL "Occasion" respL2 "NULL"

Savez-vous d’où elle provient et comment y remédier ?

Je vous remercie par avance pour votre aide.  
Bonne journée

---

<div class="post-metadata">

**Author:** ![dbenaben](https://community.france-bioinformatique.fr/user_avatar/community.france-bioinformatique.fr/dbenaben/32/43_2.png) [@dbenaben](https://community.france-bioinformatique.fr/u/dbenaben)\
**Post date:** [Mars 2, 2021, 7:43 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/erreur-avec-le-tool-withinvariation-provenant-du-toolshed/1005/2 "2021-03-02T07:43:33Z")

</div>

Bonjour Anne,

Je me permets de fermer la discussion ici (doublon) pour la continuer sur ce fil: [Withinvariation : Erreur avec test-data](https://community.france-bioinformatique.fr/t/withinvariation-erreur-avec-test-data/1007)

Bonne journée