Bonjour Brice,
Je m'interroge sur le besoin de charger toutes ces dépendances (python, samtools, perl, etc.) en plus de Trinity. Vu que vous effectuez un unique appel à Trinity dans votre script, le chargement du module trinity devrait suffire.
Si ce n'est pas le cas, c'est que nous avons vraisemblablement oublié des dépendances lors du déploiement de trinity et que nous devons corriger ce soucis.
L'empilement de différents modules me semble risqué et pourrait provoquer de nombreux conflits.
Avez-vous essayé de lancer ce traitement uniquement avec le module trinity ?
Cordialement,
Julien