Voici la documentation IFB Core Cluster dédiée à Slurm : http://taskforce-nncr.gitlab.cluster.france-bioinformatique.fr/doc/slurm_user_guide/
#!/bin/bash
#
#SBATCH --mem 40GB
bowtie2 -x hg19 -1 sample_R1.fq.gz -2 sample_R2.fq.gz -S sample_hg19.sam
$ sbatch myscript.sh
Envisage aussi d’utiliser plusieurs CPU : http://taskforce-nncr.gitlab.cluster.france-bioinformatique.fr/doc/slurm_user_guide/#parameters-for-multithreading