Bonjour,
Je lance une simulation 150ns pour une protéine de 440 d'acides aminées. Pour accélérer les étapes de PME et NB, j'avais lancer avec gpu.
Program: gmx mdrun, version 2020.2
Source file: src/gromacs/taskassignment/findallgputasks.cpp (line 86)
MPI rank: 1 (out of 2)
avec ce cmd : gmx mdrun -v -deffnm md_0_1 -pin on -nb gpu -pme gpu
Fatal error:
Cannot run short-ranged nonbonded interactions on a GPU because no GPU is
detected.
Pourtant, je me suis appris que y'as du GPU. Par contre, GROMACS ne le reconnaît pas.
Il serait très agréable qqn peut m'aider à résoudre cette problème SVP.
Merci,
Shanthosh