Installation AVAMB

IFB Core Cluster Demande de logiciel ou de banque de données
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Bonjour

j'essaie d'installer AVAMB snakemake workflow en local sur mon compte utilisateur mais sans succès (AVAMB est une évolution de Vamb déja installé en global sur le cluster).

J'ai constamment des erreurs de type: [Errno 122] Disk quota exceeded: '/shared/home/gblanc/.conda/envs/checkm2/man/man1/perl5263delta.1' et je n'arrive pas à trouver la solution

Est ce que vous pouvez l'installer en global ou bien m'accompagner pour m'aider à débugger l'installation locale?

Merci

Guillaume

PS: la recette d'installation: avamb/workflow_avamb at avamb_new · RasmussenLab/avamb · GitHub

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Bonjour @Guillaume

L'erreur "Disk quota exceeded" indique bien que le quota a été atteint.
Ici c'est le "home directory" qui dépasse la limite.
Non pas sur la taille (28.51/100G) mais sur le noimbre de fichiers (140411/100000).
Pour visualiser le quota de votre /home: lfs quota -h -p 100218 /shared/home/gblanc

C'est souvent dû à conda. Je vous invite donc à faire du ménage ou à déplacer les données/environnements dans vos espaces projets.

L'installation de AVAMB devrait rouler par la suite...