Bonjour @team.software,
J'ai essayé de compiler le programme hmmIBD comme ci-dessous. Néanmoins, est-ce possible sans les droits administrateurs? Est-il possible de l'installer sur l'IFB? Je n'ai pas vu de container disponible.
Merci!
Marie
module load compilers/1.0.4
$ gcc --version
git clone GitHub - glipsnort/hmmIBD: A hidden Markov model for detecting segments of shared ancestry (identity by descent)
gcc -Wall -c hmmIBD.c -o hmmIBD
chmod 755 hmmIBD
./hmmIBD
Bonjour,
Je ne pense pas que les droits administrateur sont nécessaire pour compiler.
Vous avez un message d'erreur quand vous essayez avec hmmIBD ?
Bonjour, merci de votre réponse rapide.
Oui, le message d'erreur est "fichier binaire impossible à lancer". Ce n'est peut-être pas la bonne façon de compiler. Auriez-vous une idée?
Merci,
Marie
Apparemment avec la commande proposer dans leur README.md, ça fonctionne mieux:
cc -o hmmIBD -O3 -lm -Wall hmmIBD.c
Voir même avec la commande:
gcc -o hmmIBD -O3 -lm -Wall hmmIBD.c
(du coup j'ai essayé d'ajouter -lm à la commande que vous avez donné dans votre premier message, mais ça ne règle pas le souci, et donc ça pourrait venir du -O3 ce qui me parait assez étrange)
Merci Beaucoup!