# Installation package R CytoTRACE

**URL:** <https://community.france-bioinformatique.fr/t/installation-package-r-cytotrace/5495>\
**Category:** Tool or data bank request\
**Created:** [Octobre 28, 2024, 9:48 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/installation-package-r-cytotrace/5495 "2024-10-28T09:48:10Z")\
**Posts on this page:** 4\
**Page:** 1

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**Author:** ![Zvelasquillo](https://community.france-bioinformatique.fr/letter_avatar_proxy/v4/letter/z/dec6dc/32.png) [@Zvelasquillo](https://community.france-bioinformatique.fr/u/Zvelasquillo)\
**Post date:** [Octobre 28, 2024, 9:48 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/installation-package-r-cytotrace/5495/1 "2024-10-28T09:48:10Z")

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Bonjour [@team.software](https://community.france-bioinformatique.fr/groups/team.software),

Serait-il possible d'installer le package R CytoTRACE?  
[https://cytotrace.stanford.edu/](https://cytotrace.stanford.edu/)

Merci,  
Zoé

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**Author:** ![arthurlebars](https://community.france-bioinformatique.fr/user_avatar/community.france-bioinformatique.fr/arthurlebars/32/1661_2.png) [@arthurlebars](https://community.france-bioinformatique.fr/u/arthurlebars)\
**Post date:** [Octobre 28, 2024, 10:45 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/installation-package-r-cytotrace/5495/2 "2024-10-28T10:45:06Z")

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Bonjour @Zvelasquillo, malheureusement [la méthode d'installation proposée par le package CytoTRACE](https://cytotrace.stanford.edu/) est incompatible avec notre pipeline d'installation de packages R actuel.

Par contre [CytoTRACE2](https://github.com/digitalcytometry/cytotrace2) est lui installable sur le cluster à priori. Est-ce qu'on installe ce package la, ou c'est vraiment CytoTRACE "v1" de [https://cytotrace.stanford.edu/](https://cytotrace.stanford.edu/) dont vous avez besoin ?

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**Author:** ![Zvelasquillo](https://community.france-bioinformatique.fr/letter_avatar_proxy/v4/letter/z/dec6dc/32.png) [@Zvelasquillo](https://community.france-bioinformatique.fr/u/Zvelasquillo)\
**Post date:** [Octobre 28, 2024, 12:32 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/installation-package-r-cytotrace/5495/3 "2024-10-28T12:32:40Z")

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Si CytoTRACE ne peut pas être installée je veux bien tester avec CytoTRACE2.

Merci @arthurlebars

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**Author:** ![ManonConnault](https://community.france-bioinformatique.fr/letter_avatar_proxy/v4/letter/m/8797f3/32.png) [@ManonConnault](https://community.france-bioinformatique.fr/u/ManonConnault)\
**Post date:** [Janvier 29, 2025, 8:46 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/installation-package-r-cytotrace/5495/4 "2025-01-29T08:46:27Z")

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Bonjour @Zvelasquillo,  
Le package CytoTrace2 a été installé sous la version 4.4.1 de R sur le cluster :

```auto
module load r/4.4.1
R
> library(CytoTRACE2)

```

Bonne journée,