Bonjour,
serait-il possible d'installer le logiciel SLR (https://github.com/luojunwei/SLR) sur le serveur de l'IFB, s'il vous plait ? Il me serait utile afin de terminer une étape de scaffolding dans l'assemblage de génomes et je ne pense pas avoir vu un logiciel équivalent et déjà installé.
Avec mes sincères salutations,
Aurélie
Bonjour @team.software,
J'espère que l'installation de ce logiciel ne vous pose aucun problème...
Tenez moi au courant que je puisse en sélectionner un autre si jamais celui-ci ne vous convient pas 
Avec mes salutations,
Aurélie
Bonjour,
Désolé pour cette réponse tardive.
Le déploiement est en cours ici : https://gitlab.com/ifb-elixirfr/cluster/tools/-/merge_requests/111
A noter que les sources de SLR datent un peu, nous avons dû faire le build avec une vieille version de gcc et bamtools v2.4.0.
Julien
Voilà @Thrylia
SLR est dispo sur le cluster : module load slr
Le module intègre également le bamtools, bwa et samtools compatibles.
Merci @Francois pour la revue.
Merci beaucoup pour cette installation et ces précisions !