Job de plus de 24h

Bonjour,

je dois lancer un job qui a déjà été interrompu car ce dernier tourne plus de 24h. Il s'agit d'un assemblage de 5 génomes avec énormément de données en entrée, d'où sa durée importante, et avec le logiciel flye. Selon mon estimation, il est probable que l'on atteigne 1 semaine de calcul.
Je me demandais s'il était possible de modifier, temporairement, la limite de temps imposée ?

Merci par avance de votre réponse :slight_smile:
Avec mes salutations distinguées,
Aurélie

Bonjour Aurélie,

Par défaut, les jobs sont dirigés vers la partition "fast" qui limite la durée des jobs à 24h.
Mais il existe la partition "long" pour les jobs longs :slight_smile:

Il suffit de spécifier l'option --partition=long, par exemple, dans le script de soumission:

#SBATCH --partition=long

Bon calcul !

Merci beaucoup pour votre réponse ! :slight_smile: