# Job failed without output

**URL:** <https://community.france-bioinformatique.fr/t/job-failed-without-output/4469>\
**Category:** IFB Core Cluster\
**Tags:** r\
**Created:** [Juillet 2, 2024, 9:29 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/job-failed-without-output/4469 "2024-07-02T09:29:51Z")\
**Posts on this page:** 6\
**Page:** 1

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**Author:** ![Claudel\_Alexis](https://community.france-bioinformatique.fr/user_avatar/community.france-bioinformatique.fr/claudel_alexis/32/1320_2.png) [@Claudel\_Alexis](https://community.france-bioinformatique.fr/u/Claudel_Alexis)\
**Post date:** [Juillet 2, 2024, 9:29 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/job-failed-without-output/4469/1 "2024-07-02T09:29:51Z")

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Bonjour,  
je lance d'habitude un script R en ssh depuis mobaxterm et tout se passe bien.  
Depuis hier, ma commande sbatch fonctionne mais le job s'arrête après quelques minutes sans aucune explication, avez-vous une idée ? rien a changé dans le script par ailleurs !  
Dernier job en question : 40496259.  
Merci !  
Alexis

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**Author:** ![dbenaben](https://community.france-bioinformatique.fr/user_avatar/community.france-bioinformatique.fr/dbenaben/32/43_2.png) [@dbenaben](https://community.france-bioinformatique.fr/u/dbenaben)\
**Post date:** [Juillet 2, 2024, 9:32 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/job-failed-without-output/4469/2 "2024-07-02T09:32:23Z")

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Bonjour,

Votre script ne renvoie pas d'erreur et semble se terminer correctement.  
Pouvez-vous nous indiquer le chemin vers votre script sbatch et la commande exécutée pour qu'on puisse regarder plus en détail ?

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<div class="post-metadata">

**Author:** ![dbenaben](https://community.france-bioinformatique.fr/user_avatar/community.france-bioinformatique.fr/dbenaben/32/43_2.png) [@dbenaben](https://community.france-bioinformatique.fr/u/dbenaben)\
**Post date:** [Juillet 2, 2024, 9:39 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/job-failed-without-output/4469/3 "2024-07-02T09:39:33Z")

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Attention vous demandez beaucoup de ressources (CPU/RAM/Time).  
Merci de vérifier et veiller au bon usage des ressources alloués: [https://ifb-elixirfr.gitlab.io/cluster/doc/troubleshooting/#slurm-how-to-use-resources-wisely](https://ifb-elixirfr.gitlab.io/cluster/doc/troubleshooting/#slurm-how-to-use-resources-wisely)  
Avant de demander autant et à moins d'être sûr, il est sans doute préférable de demander moins et d'augmenter si nécessaire.

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<div class="post-metadata">

**Author:** ![Claudel\_Alexis](https://community.france-bioinformatique.fr/user_avatar/community.france-bioinformatique.fr/claudel_alexis/32/1320_2.png) [@Claudel\_Alexis](https://community.france-bioinformatique.fr/u/Claudel_Alexis)\
**Post date:** [Juillet 4, 2024, 7:40 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/job-failed-without-output/4469/4 "2024-07-04T07:40:24Z")

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Oui merci pour votre réponse, tout roule désormais, mystère !  
Je vais essayer de réduire la voilure je comprends.  
Merci encore,  
Alexis

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**Author:** ![dbenaben](https://community.france-bioinformatique.fr/user_avatar/community.france-bioinformatique.fr/dbenaben/32/43_2.png) [@dbenaben](https://community.france-bioinformatique.fr/u/dbenaben)\
**Post date:** [Juillet 4, 2024, 8:14 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/job-failed-without-output/4469/5 "2024-07-04T08:14:29Z")

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Bonjour Alexis,

Pour info, votre job lance 99 processus `R` qui lance chacun 128 threads.

```auto
  ├─R 
  │ └─128*[{R}]
  ├─R 
  │ └─128*[{R}]
  ├─R 
  │ └─128*[{R}]
  ├─R 
  │ └─128*[{R}]
  [...]

```

C'est peut-être contre-productif et vous invite à vérifier qu'il n'y a pas de coquille

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**Author:** ![Claudel\_Alexis](https://community.france-bioinformatique.fr/user_avatar/community.france-bioinformatique.fr/claudel_alexis/32/1320_2.png) [@Claudel\_Alexis](https://community.france-bioinformatique.fr/u/Claudel_Alexis)\
**Post date:** [Juillet 8, 2024, 11:07 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/job-failed-without-output/4469/6 "2024-07-08T11:07:26Z")

</div>

Oui oui pb d'inattention de mon côté, j'ai réduit la voilure en termes de ressources demandées.  
Merci ++++