# JupyterLab - kernel R

**URL:** <https://community.france-bioinformatique.fr/t/jupyterlab-kernel-r/887>\
**Category:** IFB Core Cluster\
**Tags:** jupyter\
**Created:** [Janvier 12, 2021, 3:56 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/jupyterlab-kernel-r/887 "2021-01-12T15:56:47Z")\
**Posts on this page:** 5\
**Page:** 1

<div class="post-metadata">

**Author:** ![CVandiedonck](https://community.france-bioinformatique.fr/user_avatar/community.france-bioinformatique.fr/cvandiedonck/32/233_2.png) [@CVandiedonck](https://community.france-bioinformatique.fr/u/CVandiedonck)\
**Post date:** [Janvier 12, 2021, 3:56 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/jupyterlab-kernel-r/887/1 "2021-01-12T15:56:47Z")

</div>

Bonjour,  
Super d'avoir déployé un JupyterHub. Serait-il possible d'ajouter un noyau R?  
Merci beaucoup.

---

<div class="post-metadata">

**Author:** ![jvanhelden](https://community.france-bioinformatique.fr/user_avatar/community.france-bioinformatique.fr/jvanhelden/32/45_2.png) [@jvanhelden](https://community.france-bioinformatique.fr/u/jvanhelden)\
**Post date:** [Janvier 12, 2021, 8:47 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/jupyterlab-kernel-r/887/2 "2021-01-12T20:47:18Z")

</div>

@julien, @gildaslecorguille

La demande de Claire concerne la préparation de DUBii 2021.  
Nous voudrions utiliser un notebook Jupyter pour les prérequis (petits exercices préparés) et pour les 2 premières séances (un peu de code et un peu de markdown simple) avant de passer aux choses sérieuses avec R markdown.

Comme on a la réunion de coordination des modules de DUBii demain après-midi, ce serait bien de savoir si l'installation du noyau R sur les notebooks Jupyter de Jupterhub sera faisable ou si ça risque de poser des difficultés, auquel cas on évaluera les autres approches.

Merci !

Jacques

---

<div class="post-metadata">

**Author:** ![mariabernard](https://community.france-bioinformatique.fr/user_avatar/community.france-bioinformatique.fr/mariabernard/32/47_2.png) [@mariabernard](https://community.france-bioinformatique.fr/u/mariabernard)\
**Post date:** [Janvier 13, 2021, 10:35 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/jupyterlab-kernel-r/887/3 "2021-01-13T10:35:13Z")

</div>

Bonjour,

Tout en dehors de ce contexte lié au DUBii, la réponse m'intéresse également.

Bonne journée

Maria

---

<div class="post-metadata">

**Author:** ![julien](https://community.france-bioinformatique.fr/user_avatar/community.france-bioinformatique.fr/julien/32/1433_2.png) [@julien](https://community.france-bioinformatique.fr/u/julien)\
**Post date:** [Janvier 13, 2021, 5:09 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/jupyterlab-kernel-r/887/5 "2021-01-13T17:09:56Z")

</div>

Bonjour,

Désolé, je n'avais pas vu que le noyau R avait disparu ! C'est un effet de bord d'une mise à jour de JupyterLab.  
Je viens de réactivé le noyau R pour la version 3.6.3 et 4.0.2.  
J'ai également configuré RStudio pour qu'il utilise la dernière version de R 4.0.2.

C'est ainsi le même environnement qui est utilisé par JupyterLab, RStudio sur JupyterLab et le module r/4.0.2 du cluster.

Bonne soirée,

Julien

---

<div class="post-metadata">

**Author:** ![CVandiedonck](https://community.france-bioinformatique.fr/user_avatar/community.france-bioinformatique.fr/cvandiedonck/32/233_2.png) [@CVandiedonck](https://community.france-bioinformatique.fr/u/CVandiedonck)\
**Post date:** [Janvier 14, 2021, 1:10 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/jupyterlab-kernel-r/887/6 "2021-01-14T13:10:17Z")

</div>

Super! Merci Julien!!!