# Librairies R manquantes sous RStudio

**URL:** <https://community.france-bioinformatique.fr/t/librairies-r-manquantes-sous-rstudio/46>\
**Category:** Tool or data bank request\
**Tags:** rstudio\
**Created:** [Février 20, 2019, 1:35 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/librairies-r-manquantes-sous-rstudio/46 "2019-02-20T01:35:57Z")\
**Posts on this page:** 3\
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**Author:** ![jvanhelden](https://community.france-bioinformatique.fr/user_avatar/community.france-bioinformatique.fr/jvanhelden/32/45_2.png) [@jvanhelden](https://community.france-bioinformatique.fr/u/jvanhelden)\
**Post date:** [Février 20, 2019, 1:35 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/librairies-r-manquantes-sous-rstudio/46/1 "2019-02-20T01:35:57Z")

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On a installé aujourd’hui l’environnement conda pour le module 3 du DU-Bii “Analyse statistique avec R”.

Quand j’essaie d’utiliser le serveur RStudio les nouveaux packages ne sont apparemment pas chargés (par exemple clues). Je me demande si ce n’est pas parce qu’il s’appuyait sur l’ancien nom du module.

Si c’est le cas ce sera problématique pour la séance de demain après-midi, car les apprenants ne pourront pas charger les librairies R et Bioconda qu’on a prévues pour eux.

Pourriez-vous vérifier ?

Merci

Jacques

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**Author:** ![julien](https://community.france-bioinformatique.fr/user_avatar/community.france-bioinformatique.fr/julien/32/1433_2.png) [@julien](https://community.france-bioinformatique.fr/u/julien)\
**Post date:** [Février 20, 2019, 7:28 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/librairies-r-manquantes-sous-rstudio/46/2 "2019-02-20T07:28:22Z")

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Le serveur RStudio et l’environnement conda m3 sont deux choses distinctes. Nous n’avons pas encore un environnement R mutualisé entre RStudio et le cluster.  
Devons-nous intégrer les packages suivant sur RStudio ?

```auto
r-knitr
r-kableextra
r-formattable
r-roxygen2
r-yaml
r-e1071
r-randomforest
r-tidyverse
r-factominer
r-factoextra
r-cowplot
r-corrplot
r-gridExtra
r-ade4
r-vegan
r-ggpubr
r-clues
bioconductor-deseq2
bioconductor-edger 
bioconductor-limma
bioconductor-qvalue
bioconductor-multtest
r-mixomics
bioconductor-recount
r-momr
r-mofa

```

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**Author:** ![gildaslecorguille](https://community.france-bioinformatique.fr/user_avatar/community.france-bioinformatique.fr/gildaslecorguille/32/6_2.png) [@gildaslecorguille](https://community.france-bioinformatique.fr/u/gildaslecorguille)\
**Post date:** [Février 20, 2019, 9:03 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/librairies-r-manquantes-sous-rstudio/46/4 "2019-02-20T09:03:42Z")

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C’est fait @jvanhelden