# Mémoire allouée

**URL:** <https://community.france-bioinformatique.fr/t/memoire-allouee/6885>\
**Category:** Galaxy\
**Tags:** galaxy\_memory\
**Created:** [Septembre 4, 2026, 7:32 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/memoire-allouee/6885 "2026-09-04T07:32:53Z")\
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**Author:** ![cel](https://community.france-bioinformatique.fr/letter_avatar_proxy/v4/letter/c/35a633/32.png) [@cel](https://community.france-bioinformatique.fr/u/cel)\
**Post date:** [Septembre 4, 2026, 7:32 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/memoire-allouee/6885/1 "2026-09-04T07:32:53Z")

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Bonjour,

Je mets actuellement à jour une formation lors de laquelle je souhaiterais utiliser l’outil « Convert GTF to BED12 ». Cependant avec la version d’annotations que je souhaite utiliser (GTF d’Ensembl 116) j’obtiens l’erreur « This job was terminated because it used more memory than it was allocated » (cela fonctionnait avec des précédentes versions d’annotations, mais le nombre de transcrits ayant augmenté, j’obtiens maintenant cette erreur). Je peux faire cette conversion de mon côté et fournir aux participants le fichier BED (je peux aussi leur indiquer qu’ils peuvent le faire avec [https://usegalaxy.org/](https://usegalaxy.org/) avec lequel je n’ai pas cette erreur), mais j’aurais souhaité savoir s’il y avait une solution pour leur proposer pour le faire dans [https://usegalaxy.fr](https://usegalaxy.fr) (j’ai en effet lu dans une demande similaire que vous aviez augmenté les ressources allouées pour un outil).  
Merci beaucoup d’avance !

Céline

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**Post date:** [Septembre 4, 2026, 7:54 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/memoire-allouee/6885/2 "2026-09-04T07:54:45Z")

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Bonjour,

Nous pouvons effectivement augmenter la mémoire allouée aux outils installés sur [UseGalaxy.fr](http://UseGalaxy.fr)  
Le changement pour l'outil GTF to BED12 (toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/iuc/gtftobed12/gtftobed12) sera effectif courant de la semaine prochaine.

Quand a lieu votre formation ?

Merci !  
Guillaume

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**Author:** ![cel](https://community.france-bioinformatique.fr/letter_avatar_proxy/v4/letter/c/35a633/32.png) [@cel](https://community.france-bioinformatique.fr/u/cel)\
**Post date:** [Septembre 4, 2026, 7:57 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/memoire-allouee/6885/3 "2026-09-04T07:57:13Z")

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Merci beaucoup pour votre retour ! La formation aura lieu du 28 au 30 septembre.

Je testerai donc lorsque vous aurez effectué le changement.

Merci beaucoup !

Céline

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**Author:** ![gkermorgant](https://community.france-bioinformatique.fr/letter_avatar_proxy/v4/letter/g/e47774/32.png) [@gkermorgant](https://community.france-bioinformatique.fr/u/gkermorgant)\
**Post date:** [Septembre 7, 2026, 1:58 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/memoire-allouee/6885/4 "2026-09-07T13:58:00Z")

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Bonjour Céline,

Nous avons augmenté la mémoire allouée à gtftobed12 ce matin, vous pouvez retester !  
Si vous constatez toujours la même erreur, pouvez-vous nous envoyer un rapport d'erreur depuis [usegalaxy.fr](http://usegalaxy.fr) ? Vous pouvez accéder à un formulaire depuis l'onglet "Error"

Merci et bonne semaine

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**Author:** ![cel](https://community.france-bioinformatique.fr/letter_avatar_proxy/v4/letter/c/35a633/32.png) [@cel](https://community.france-bioinformatique.fr/u/cel)\
**Post date:** [Septembre 7, 2026, 3:16 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/memoire-allouee/6885/5 "2026-09-07T15:16:06Z")

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Bonjour Guillaume,

Merci beaucoup, cela fonctionne très bien à présent, c'est parfait !

Merci encore et bonne semaine.

Céline