Bonjour,
J'ai lancé hier 2 runs TREEMIX avec les options -tf et -se ("computationally intensive"), avec 250 GB de mémoire. Les deux ont été arrêtés avec statut "out of memory".
Je suis étonné car les nombreux runs que j'ai lancés dernièrement sur Treemix se sont déroulés sans pbm.
Les deux runs en question:
24518292
24518290
Voici le résultat de seff sur l'un des deux runs (res identique sur l'autre):
(09:08:59) ewicker@clust-slurm-client:/shared/projects/pop_genomics_of_fusarium_foc/TREEMIX/TEST3$ seff 24518292
Job ID: 24518292
Cluster: core
User/Group: ewicker/ewicker
State: OUT_OF_MEMORY (exit code 0)
Cores: 1
CPU Utilized: 00:03:04
CPU Efficiency: 56.62% of 00:05:25 core-walltime
Job Wall-clock time: 00:05:25
Memory Utilized: 240.62 GB
Memory Efficiency: 96.25% of 250.00 GB
En l'absence d'autre solution, pouvez-vous m'ouvrir un accès à la partition bigmem ?
Merci d'avance et bonne journée,
Emmanuel