Problème ipyrad

Bonjour
j'ai lancé un script ipyrad. Il a démarrée sur le noeud 93 (job 40599960), l'analyse se lance mais elle reste bloquée à la première étape depuis plusieurs heures:
Step 1: Loading sorted fastq data to Samples
No PE fastq pairs detected based on filenames, assuming SE data.
[ ] 0% 12:41:03 | loading reads (base) [daurelle@core-login2 ~]$

La semaine dernière sur des données similaires cela fonctionnait. A quoi cela peut il être dû?
merci
Didier

Mise à jour. L'analyse se lance bien sur le noeud 89. J'ai un peu modifié le script (changement dans le fichier de paramètres), mais est ce la seule raison?
merci
Didier

Bonjour Didier,

Un espace de stockage est arrivé à saturation sur le noeud, d'où le blocage.
Et par conséquent cela fonctionne sur un autre noeud.

On regarde pour éviter ce genre de blocage.

Bonjour
merci pour l'information sur le noeud.
Pour le noeud 89 j'ai un nouveau problème sur l'étape 3 après le mapping sur le génome:
" Encountered an Error.
Message: IPyradError: bwa error: None"
à quoi cela peut il être dû?
merci
Didier

Nouvelle mise à jour: apparemment je dépasse le quota d'espace disque. . Je vais demander une extension
Didier

C'est bien ça :slight_smile:

Bonjour
je confirme que ça fonctionne bien lorsqu'il y a suffisamment d'espace disque
merci
Didier