Bonjour Guillaume,
Difficile de dire ce qui ne va pas exactement.
Fin avril la version de R utilisé sur RStudio a été mis à jour (Mise à jour de R sur le serveur RStudio - #19 par Francois), passant de R 3.5 à 3.6 (et les packages ont suivi).
Peut-être que le package EACON ou ASCAT a un problème sur cette nouvelle version ?
Peut-être pouvez-vous essayer en utilisant l'ancienne version de R sur le cluster (RStudio utilise la version r/3.6.1 mais plusieurs versions de R sont disponibles sur le cluster: r/3.5.1 r/3.6.3 r/4.0) ?
Depuis core.cluster.france-bioinformatique.fr:
module load r/3.5.1
Sinon, toujours sur le cluster, vous pouvez peut-être tester directement le module r-eacon disponible:
module load r-eacon/0.3.4_1
En ligne de commande, on aura peut-être aussi plus d'info (le "unexpected crash" ne nous aide pas beaucoup 
).
Dites-nous ce que vous en pensez ou si vous avez pu tester.
Bonne journée