Merci pour ce retour complet.
Je n'arrive pas à reproduire exactement le problème. Toutefois, je note bien un problème avec pip sur la version python 2.7 (discuté ci-dessous).
Il n'y a pas de sessions à "réinitialiser". Tout est stocké dans votre répertoire /home.
Vous pouvez éventuellement supprimer le répertoire .local utilisé par pip (avec le répertoire .cache): rm -rf ~/.local.
A noter que la version python fournit par le système par défaut n'est pas celle à privilégier.
Nous vous invitons plutôt à utiliser les versions en module.
$ module available python
------------------------- /shared/software/modulefiles -------------------------
python/2.7 python/3.7
# Charge python 2.7
$ module load python/2.7
Ces versions ont déjà les package numpy et biopython (cf python/2.7 ou python/3.7).
Vous pouvez ensuite installer ray et psutils avec pip dans votre /home.
Mais, comme je le disais, j'ai noté un problème avec pip sur la version 2.7.
Il ne faut pas faire pip install ray --user mais:
python -m pip install ray --user
python -m pip install psutil --user
De même pour upgrade pip
python -m pip install --upgrade pip
Pouvez-vous essayer avec cette méthode ?
Je ne suis pas très familier avec pip, ni python et je n'ai pas encore compris d'où venait le problème.
Je vous propose de continuer à en discuter ici si on trouve une explication.
Nous pouvons aussi si besoin installer pour vous ces packages ou vous pouvez directement nous proposer des modifications sur le dépôt conda-env: https://gitlab.com/ifb-elixirfr/cluster/conda-env/