Bonjour @team.software,
Serait-il possible d'installer le logiciel fastsimcoal, la version 2 disponible ici : fastsimcoal26 ?
Ce n'est pas la dernière version du logiciel mais j'ai besoin de celle-ci pour reprendre des analyses faites avec la version 2.
C'est un logiciel de simulations de données génomiques sous des scénarios complexes.
Merci d'avance pour votre aide.
Aude
Bonjour,
Comme il fournissent un zip, vous pouvez l'installer directement sur votre compte en vous connectant en ssh sur le cluster.
Par exemple comme ceci:
mkdir fastsimcoal
cd fastsimcoal
wget http://cmpg.unibe.ch/software/fastsimcoal26/downloads/fsc26_linux64.zip
unzip fsc26_linux64.zip
cd fsc26_linux64/
chmod +x fsc26
Attention, contrairement a ce qu'indique la doc, le binaire fourni se nomme fsc26
Vous pouvez donc le lancer par exemple comme ca:
srun ./fsc26 -i [le fichier en entrer] -n 100