Bonjour,
Je me suis aperçu que mes jobs (fasterq-dump) plantent systematiquement sur cetrains noeuds.
Il est possible que ça soit dû à la saturation de la partition /var
C'est en ce moment le cas sur les neuds suivants :
cpu-node-73
cpu-node-19
cpu-node-2
cpu-node-20
cpu-node-21
cpu-node-22
cpu-node-24
par avance merci,
Vladimir
Bonjour Vladimir,
En effet, nous avons bien constaté une saturation de /var sur ces nœuds de calcul (10Go --> 0Go).
C'est probablement dû au mécanisme de cache de SRA Toolkit.
Je n'ai pas réussit à reproduire le problème.
Il semble possible de désactiver ce système de cache ou de le paramétrer.
Quelques pistes:
P'têtre essayer de le désactiver via vdb-config -i ?
Les /var sont revenus à la normale.
J'avais pourtant pensé au cache et verifié s'il y avait des fichier m'appartenant dans /var .... un peu trop rapidement sans doute.
J'ai désactivé le cache et vais retenter.
merci.
Bonjour Vladimir,
Cela semble avoir fonctionné, vous nous confirmez ?
Bonne journée
Oui. Ça a fonctionné.
Merci 