# \#bonjour

**URL:** https://community.france-bioinformatique.fr/tag/bonjour/28.md

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## [Compilation de Rmd en pdf sur serveur RStudio](https://community.france-bioinformatique.fr/t/compilation-de-rmd-en-pdf-sur-serveur-rstudio/534)

<div class="topic-metadata">

**Author:** [@jvanhelden](https://community.france-bioinformatique.fr/u/jvanhelden)\
**Réponses:** 2\
**Dernière mise à jour :** [Août 21, 2020, 5:01 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/compilation-de-rmd-en-pdf-sur-serveur-rstudio/534 "2020-08-21T17:01:21Z")

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Nous préparons sur le serveur RStudio un R markdown pour le cours de DUBii, et la compilation fonctionne bien en HTML, mais pas en pdf. Voici le message d'erreur. Y a-t-il moyen de régler l'export pdf ? Merci Olivier…

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## [Phyml en mode multi-processeurs](https://community.france-bioinformatique.fr/t/phyml-en-mode-multi-processeurs/525)

<div class="topic-metadata">

**Author:** [@jvanhelden](https://community.france-bioinformatique.fr/u/jvanhelden)\
**Réponses:** 1\
**Dernière mise à jour :** [Mai 27, 2020, 10:03 UTC](https://community.france-bioinformatique.fr/t/phyml-en-mode-multi-processeurs/525 "2020-05-27T10:03:41Z")

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J'essaie de faire tourner phyml en mode multi-processeurs sur le cluster avevc la commande phyml-mpi. Je charge d'abord l'environnement conda où j'ai défini tous les outils. cd ~jvanhelden/coronavirus\_insertions module…