Acces à la demande à la partition gpu

IFB Core Cluster Account and project management
205

Bonjour,
Je voudrais avoir accès à la partition gpu pour l'utilisateur bbergkpinto pour faire du basecalling. Est-ce-possible?
Merci.

206

Bonjour @bbergkpinto

Il faut au préalable demander un espace projet (en se connectant à https://my.cluster.france-bioinformatique.fr/ puis "Request a new project").

207

Bonjour,
Je viens de faire mon espace projet. Pourriez-vous me donner accès à la partition gpu pour le projet anodosum s'il-vous-plaît?
Merci.

208

Bonjour, j'aimerais avoir accès aux partitions GPU pour pouvoir faire tourner guppy.

utilisateur :lblondin, projet : mg_virus

merci par avance,

209

Bonjour,

@bbergkpinto c'est fait. Désolé pour le délai de réponse...

@lblondin c'est fait.

Pensez bien à spécifier la partition (--partition=gpu), votre projet (--account=<votre-projet>) et à vérifier que le GPU est vraiment utilisé lors de votre traitement (https://ifb-elixirfr.gitlab.io/cluster/doc/troubleshooting/#slurm-how-to-use-resources-wisely ).

210

Bonjour,

Serait-il possible d'avoir accès à la partition GPU pour utiliser AlphaFold ?
user : cmorival
projet : abca4_g1961e

Merci beaucoup!

211

Bonjour,
Pourriez-vous me donner un accès à la partition gpu pour le projet seabioz (user crousseau) s'il-vous-plaît?
Merci d'avance!

212

Bonjour

@cmorival c'est fait.
@crousseau c'est fait.

Pensez bien à spécifier la partition (--partition=gpu), votre projet (--account=<votre-projet>) et à vérifier que le GPU est vraiment utilisé lors de votre traitement (https://ifb-elixirfr.gitlab.io/cluster/doc/troubleshooting/#slurm-how-to-use-resources-wisely ).

Bonne journée

1 « J'aime »
213

Bonjour,

Pourriez-vous me donner accès à la partition gpu pour le projet space_transcriptomix ? (nom d'utilisateur bsamson)

En vous remerciant !

214

Bonjour @bsamson,
C'est fait.
Bonne journée

215

Bonjour,

Est-ce que le projet darkdino_alphafold (utilisateur jrousseau) a toujours accès à la partition gpu ?
Si ce n'est pas le cas, est-il possible d'y avoir accès, pour utilisation de MassiveFold / AlphaFold ?

Merci par avance.

216

Bonjour @jrousseau

Vous avez toujours accès à la partition GPU pour ce projet.

Bonne journée

217

Bonjour,
Serait il possible d'avoir accès à la partition GPU pour le projet massivefold_prediction que j'ai créé ?
Merci
Bien cordialement
Mathilde Carpentier

218

Bonjour @mcarpentier

C'est fait.

Pensez bien à spécifier la partition (--partition=gpu), votre projet (--account=<votre-projet>) et à vérifier que le GPU est vraiment utilisé lors de votre traitement (https://ifb-elixirfr.gitlab.io/cluster/doc/troubleshooting/#slurm-how-to-use-resources-wisely ).

Bonne journée

219

Bonjour,
Serait-il possible d'avoir un accès à la partition GPU pour effectuer du clustering avec des réseaux de neurones sur les données single cell (projet : scivar, user: tberthet) ?

Merci d'avance et bonne journée

220

Bonjour @tberthet

C'est fait. Désolé pour ce retour tardif.

Bonne journée

221

Bonjour,

Pourrais-je avoir accès à la partition gpu ?
Cela serait pour :

  • projet: clostridium_nanopore
  • user: vmesaschein

Merci d'avance,

222

Bonjour @vmesaschein

C'est fait.
Pensez bien à spécifier la partition (--partition=gpu), votre projet (--account=<votre-projet>) et à vérifier que le GPU est vraiment utilisé lors de votre traitement (https://ifb-elixirfr.gitlab.io/cluster/doc/troubleshooting/#slurm-how-to-use-resources-wisely ).

Bonne journée

1 « J'aime »
223

Bonjour,
Pourriez-vous donner l'accès à la partition gpu au compte:
gwenaellumet
Pour les projets:
breast_pathology_img
comet

Merci d'avance, bonne journée !

224

Bonjour @gwenaellumet1

C'est fait pour comet. C'était déjà le cas pour breast_pathology_img.

Bonne journée