Acces à la demande à la partition gpu

Super merci beaucoup
Bonne journée

Bonjour,

Serait-il possible d'avoir accès à la partition GPU pour mon compte gbriere, projet ml_het_bio_nets ?

Merci d'avance,
Galadriel

Bonjour,
Pourriez -vous donner l'accès à la partition gpu au compte chrye pour le projet "predict_protein_str"

Merci d'avance
Cordialement,
Christophe

Bonjour,

@gbriere, c'est fait.

@chrye c'est fait.

Pensez bien à spécifier la partition (--partition=gpu), votre projet (--account=<votre-projet>) et à vérifier que le GPU est vraiment utilisé lors de votre traitement (https://ifb-elixirfr.gitlab.io/cluster/doc/troubleshooting/#slurm-how-to-use-resources-wisely ).

Bonne journée

Bonjour, dxésolé pour le doublon, j'ai fait une fausse manip
Je souhaiterai avoir accès à la partition gpu pour pouvoir faire du basecalling high-fideltiy avec Guppy sur fichiers fast5.
Nom d'utilisateur : acousson
Nom de projet : u2worm_guppy_high_fidelity_basecalling

Merci d'avance.

Arthur Cousson

Bonjour @nc-support !
Pourriez vous svp me donner accès au gpu ? je voudrais lancer dorado...
Mon user : jorjuela
Mon projet: poacembly
Merci bcp et bon Jobim si vous êtes à Toulouse.
Julie

C'est fait Julie,

Bonne journée
Nicole

C'est fait Arthur

Bonne journée, Nicole

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Bonjour,

J'aurais besoin d'accéder à la partition gpu sur mon compte (delattrem) pour le projet "comet"

Merci d'avance,
Bonne journée,
Mathieu

Bonjour @delattrem ,

C'est fait.
Pensez bien à spécifier la partition (--partition=gpu), votre projet (--account=<votre-projet>) et à vérifier que le GPU est vraiment utilisé lors de votre traitement (https://ifb-elixirfr.gitlab.io/cluster/doc/troubleshooting/#slurm-how-to-use-resources-wisely ).

Bonne journée

1 « J'aime »

Bonjour,
Je souhaiterais accéder à la partition GPU pour les projets popgen_reunion_harrier et datepalm (compte ybourgeois).
Merci beaucoup,
Yann

Bonjour Yann, c'est fait.

Bonne journée, Nicole

Bonjour @nc-support !
Pourriez vous me donner accès à la partition GPU, s'il vous plaît ? Tout d'abord, j'aimerais lancer dorado.
Mon user : fmarques
Mon projet : erc_medisyn
Merci beaucoup,
Filipe

Bonjour @fmarques

C'est fait.
Pensez bien à spécifier la partition (--partition=gpu), votre projet (--account=<votre-projet>) et à vérifier que le GPU est vraiment utilisé lors de votre traitement (https://ifb-elixirfr.gitlab.io/cluster/doc/troubleshooting/#slurm-how-to-use-resources-wisely ).

Bonne journée

1 « J'aime »

Bonjour,
j'aimerai faire des expériences depuis le JupyterLab avec un GPU. Lorsque je lance ma session, jupyter, impossible de sélectionner le bon hardware. Que faut il faire ?
Merci pour votre aide,
Alban

Bonjour Alban,

Il faut que l'on donne accès à la partition GPU pour pouvoir y accéder.
Et il te faut un espace projet sur lequel travaillé (et pour lequel on te donnera accès à la partition GPU).

  1. Demander un projet sur l'IFB: https://my.cluster.france-bioinformatique.fr/ (bouton "Request a new project")
  2. Demander l'accès sur le forum (https://community.france-bioinformatique.fr) en précisant ton login et projet

Dis-moi le projet et on te donnera l'accès en suivant.

Bonjour,

Je voudrais aussi avoir accès à la partition cpu pour le projet dysmac.
Merci

Bonjour @adonkpegan

Je suppose que vous vouliez parler de la partition gpu. Auquel cas, c'est fait :slight_smile:

Pensez bien à spécifier la partition (--partition=gpu), votre projet (--account=<votre-projet>) et à vérifier que le GPU est vraiment utilisé lors de votre traitement (https://ifb-elixirfr.gitlab.io/cluster/doc/troubleshooting/#slurm-how-to-use-resources-wisely ).

Oui gpu, merci.
Dans le lien que vous avez donné pour vérifier l'utilisation des ressources, j'ai essayé la commande seff mais elle est introuvable.

Command 'seff' not found, did you mean:
command 'siff' from snap siff (1.0.0.0)
command 'serf' from deb serf (0.8.5~ds1-1)

Bonjour,
merci pour ce retour, entre temps j'ai eu accès au mésocentre de proximité GLICID. Je vous recontacte si j'ai besoin de déposer un projet.
Merci,
Alban