Acces à la demande à la partition gpu

Bonjour,
Serait-il possible de me donner accès à la partition GPU pour le projet umisyn_nanocluster ? (login : bfaussurier)
Bonne journée,

Bonjour @b_faussurier

C'est fait. Pensez à vérifier le bon usage des ressource: https://ifb-elixirfr.gitlab.io/cluster/doc/troubleshooting/#slurm-how-to-use-resources-wisely

Bon après-midi

Bonjour @nc-support,
Je voudrais demander l'accès à la partition GPU pour utiliser alphafold.
Nom d'utilisateur : cmouville
Nom de projet : nmeningitidis_phage_interaction

C'est la première fois que j'utilise un cluster donc je compte suivre les recommandations données sur IFB Core Cluster Documentation . Est-ce suffisant pour l'apprentissage ou avez vous une formation / mooc à recommander ?

Merci et bonne journée,

Bonjour,

La documentation peut suffire si vous êtes à l'aise avec les environnements Unix.
alphafold est quand même assez pointu à utiliser. Je vous conseille de bien comprendre le fonctionnement d'un job/cluster avant de vous lancer dans alphafold et surtout de toujours contrôler l'usage des ressources: https://ifb-elixirfr.gitlab.io/cluster/doc/troubleshooting/#slurm-how-to-use-resources-wisely

@team.alphafold peut-être avez-vous une recommendation ?

@cmo vous avez maintenant accès à la partition GPU

Bonjour,

Je souhaiterais avoir si possible accès à la partition gpu.

Projet : bsv_assembly_gaba
Utilisateur : asoriano

Merci à vous et bonne journée.

Bonjour @Alexandre_S

C'est fait. Vous avez maintenant accès à la partition GPU.

Bonne journée

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Bonjour,
Serait-il possible d'avoir accès à la partition GPU pour le projet segmentation_tumor_pancreas pour l'utilisateur rdaubairetemmem

Merci d'avance.

Bonjour @rdaubairetemmem ,

C'est fait. Pensez à bien vérifier l'usage des ressources: https://ifb-elixirfr.gitlab.io/cluster/doc/troubleshooting/#slurm-how-to-use-resources-wisely

Bonne fin de journée

Bonjour,

Serait-il possible d'avoir accès à la partition GPU :
projet : rp3
utilisateur : tduigou

Merci et bonne fin de journée,

Bonjour @tduigou

C'est fait.
Pensez à bien vérifier l'usage des ressources: https://ifb-elixirfr.gitlab.io/cluster/doc/troubleshooting/#slurm-how-to-use-resources-wisely

Bonne journée

Bonjour, j'aimerai un accès à la partition GPU pour le projet : 'pdac_dl', login : 'remynicolle' et 'tbourega'.
Merci, bonne journée.

Bonjour,

remynicolle ne fait pas partis du projet pdac_dl.
Je vous laisse le soin de l'ajouter via https://my.cluster.france-bioinformatique.fr/ si besoin
Je vous ajouterais alors à la partition GPU.

Bonjour, j'aimerais avoir accès aux partitions GPU pour pouvoir faire tourner AlphaFold2,
pouvez-vous me donner l'accès?
Utilisateur: qhelleu, projet : cnidarian_tardigrade_prot_stru
Merci
Quentin

Bonjour @qhelleu

C'est fait.
N'oubliez pas de spécifier la partition (--partition=gpu) et votre compte (--account=<votre-projet>).
Pensez également à bien vérifier le bon usage des ressources (https://ifb-elixirfr.gitlab.io/cluster/doc/troubleshooting/#slurm-how-to-use-resources-wisely

Bonne journée

1 « J'aime »

Bonjour, j’aimerai avoir accès a la partition GPU avec le compte tdurand projet culex_mosquito_astre pour faire tourner beast, guppy medaka, ... merci d'avance

Théo

Bonjour @thdurand

C'est fait.
Pensez à vérifier le bon usage des ressources, notamment du GPU (https://ifb-elixirfr.gitlab.io/cluster/doc/troubleshooting/#slurm-how-to-use-resources-wisely)

Bonne journée

Bonjour, j'aimerais avoir accès aux partitions GPU pour pouvoir faire tourner AlphaFold2,
pouvez-vous me donner l'accès?
Utilisateur: aherrero, projet : eleos
Merci
Alba

Bonjour @aherrero

C'est fait.
N'oubliez pas de spécifier la partition (--partition=gpu) et votre compte (--account=<votre-projet>).

Pensez également à vérifier le bon usage des ressources (https://ifb-elixirfr.gitlab.io/cluster/doc/troubleshooting/#slurm-how-to-use-resources-wisely

Bonne journée

Bonjour,

Serait-il possible d'avoir accès à la partition GPU concernant le projet machinelearning_popgen pour l'utilisateur tchambe et mdemeulle

Merci d'avance.