Merci beaucoup !
Bonne journée,
LK
Merci beaucoup !
Bonne journée,
LK
Bonjour @julien
C'est vraiment résolu?
Je n'arrive pas à ouvrir R (après module load of course)
j'ai un "bash: R : commande introuvable".
Soit je suis vraiment à côté de mes pompes aujourd'hui, soit il se passe qqchose...
Merci pour votre aide
Pierre
Le module R est en cours de maintenance, c'est juste un mauvais timing je crois
@Francois tu confirmes ?
yes je confirme, j'espere que ca revient bientot
Rétablir l'env R 3.5.1 semble être un peu plus compliqué que prévu, ca sera probablement dispo en début de semaine prochaine.
Bonjour
le cluster est toujours down ce matin ?
merci
Hélène
Bonjour,
Oui on a eu un souci ce matin, le même que l'autre jour, mais normalement c'est revenu.
R n'est toujours pas disponible par contre.
ok merci & bon courage
par contre toujours pas d'accès au cluster de chez moi :
(base) MacBookrHelene3:PAPIER_SALIVARIUS helenechiapello$ ping core.cluster.france-bioinformatique.fr
PING core.cluster.france-bioinformatique.fr (192.54.201.181): 56 data bytes
Request timeout for icmp_seq 0
Request timeout for icmp_seq 1
Request timeout for icmp_seq 2
Request timeout for icmp_seq 3
Request timeout for icmp_seq 4
Request timeout for icmp_seq 5
Request timeout for icmp_seq
Bonjour,
J'ai également un souci de connexion ce matin pour accéder à ma session de travail. La session reste sur la ligne "Waiting for JOBID 6296685 to start".
Est-ce normal étant donné que le pb semble réglé ?
Merci d'avance !
Bonjour,
Y a-t-il du nouveau sur le cluster ? Ma connexion est toujours bloquée et je ne sais pas si ce problème est du à ma machine ou au serveur qui est toujours en panne.
Merci pour l'info !
Baptiste
Bonjour Baptiste,
L'accès au cluster est possible depuis ce matin.
Il est possible que si vous aviez une connexion ouverte, celle-ci soit "bloqué". Il faut alors se reconnecter.
Faites-nous signes si jamais vous ne pouvez pas vous reconnecter.
@dbenaben
Je viens d'essayer de rouvrir une session mais j'ai toujours le même problème. Quand j'essaie d'accéder à ma session, je reste sur un message d'attente (Wainting for JOBID 629881 to start) sans qu'il n'y ait de connexion.
@bmartin Merci pour l'essai.
Je crois que je commence à comprendre. En fait, l'accès au cluster fonctionne. Ce sont les sessions "sinteractive
" qui ne sont pas terminées correctement.
Vous avez actuellement 7 "sessions" en tain de tourner (et 4 en attentes).
Est-ce que vous utilisez plusieurs sessions ou est-ce que ce sont des sessions en "erreur" ?
Dis-autrement, est-ce que vous utilisez une seule session ou plusieurs simultanément ?
Si ce sont bien des sessions "en erreur", je me permettrais alors de les tuer pour que vous puissiez en relancer.
@dbenaben
Je n'ai actuellement aucune session ouverte donc vous pouvez fermer toutes les sessions. Qu'est ce que j'ai fait de travers pour ne pas réitérer le problème ? Est-ce que j'ai un moyen de le vérifier si jamais cela se reproduit pour éviter de relancer le forum inutilement ?
Merci bien !
BM
@bmartin Ok. Je viens de tuer les sessions "fantômes".
Vous pouvez réessayer, ça devrait maintenant rouler.
Je ne sais pas vous dire précisément pourquoi ce problème apparaît.
Est-ce que vous fermer votre session mobaxterm sans arrêter la session (il faut taper exit
avant de quitter mobaxterm) ? Est-ce que vous avez eu des déconnexions ?
Pour voir vos sessions/jobs en cours, une fois connecté au cluster vous pouvez taper squeue -l -u bmartin
.
A chaque JobID corresponds une session (ou un job). Par exemple:
JOBID PARTITION NAME USER STATE TIME TIME_LIMI NODES NODELIST(REASON)
6294707 fast _interac bmartin RUNNING 8:43:29 1-00:00:00 1 cpu-node-7
6296685 fast _interac bmartin RUNNING 3:11:58 1-00:00:00 1 cpu-node-32
6295329 fast _interac bmartin RUNNING 4:48:59 1-00:00:00 1 cpu-node-9
6294618 fast _interac bmartin RUNNING 22:06:47 1-00:00:00 1 cpu-node-17
Si les sessions sont anormales, il est possible de les annuler à l'aide de scancel
, ou de nous le signaler pour que l'on regarde avec vous.
Bonne soirée
@dbenaben
Tout est rentré dans l'ordre, super ! Effectivement, j'ai eu quelques déboires avec ma machine aussi de mon côté ce qui a du entraîner ces sessions fantômes. Je ferai attention par la suite. Je note la procédure en cas de pb.
Merci en tout cas !
BM