Claire Vandiedonck me pose une question qui me semble intéressante à aborder au niveau général.
Elle est dans la phase d'analyse d'un projet de recherche où elle a généré des fichiers bigWig, qu'elle aimerait visualiser sur le navigateur de génomes UCSC (https://genome.ucsc.edu/).
Auparavant on pouvait téléverser sur ce serveur des bigWig dans son espace perso, mais ils ne le permettent plus. UCSC propose des solutions
https://genome.ucsc.edu/goldenpath/help/hgTrackHubHelp.html#Hosting pour rendre les fichiers accessibles:
- via github mais c'est trop gros,
- via zenodo mais ceci signifie qu'on publie les données alors qu'on est aux balbutiements de l'analyse
- cyverse (https://cyverse.org/), à explorer
Dans tous les cas ceci demande de déplacer les données vers un serveur extérieur. Je voudrais savoir s'il y aurait moyen, pour les comptes hébergés sur un serveur du NNCR, d'obtenir un URL qu'on pourrait renseigner à UCSC genome browser ? Ceci pourrait passer par exemple par un protocole sftp avec mot de passe mais peut-être aussi par des couloirs dont vous connaissez le secret.
Merci
Jacques