J'ai des soucis avec le Metabolights Downloader sur la nouvelle instance. L'affichage HTML du fichier de sortie ne fonctionne pas. Il me semble qu'il faut autoriser Galaxy à afficher l'HTML outil par outil. Pourriez-vous voir cela s'il-vous-plaît ?
Peux-tu me donner le nom de l'outil suivant ce format : https://gitlab.com/ifb-elixirfr/usegalaxy-fr/infrastructure/-/blob/preprod/templates/galaxy/sanitize_whitelist.txt ?
Si je ne dis pas de bêtises, cela corresponds à
toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/prog/mtblsdwnld/mtbls-dwnld/4.1.4
Pour info (note à moi-même), on obtiens ce lien via le menu Options (en haut à droite de l'outil), puis Get Link :
https://workflow4metabolomics.usegalaxy.fr/root?tool_id=toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/prog/mtblsdwnld/mtbls-dwnld/4.1.4
@gildaslecorguille faut ajouter le lien dans la whitelist (MR) ?
Il y est déjà :
Donc solved
Malheureusement cela ne fonctionne toujours pas. Vous pouvez faire un essai de votre côté avec mtbls-dwnld avec comme nom d'étude MTBLS174 par exemple.
En effet... Pourtant après vérification sur l'interface d'administration, l'outil est bien sur la "whitelist"...
@team.w4m avez-vous déjà rencontré ce problème ?
@pkrog , est-ce tu peux me partager un historique que je puisse regarder dans les logs ?
C'est fait.
Le datatype est isa-tab
. J'imagine que pour afficher du html, il faut que le datatype soit html
.
Curieusement, je n'ai pas été autorisé à changer le datatype pour tester.