Bonjour,
Comme suspecté, c'est bien le nombre de fichiers qui pose problème ici : avec 1440 fichiers (ce qui donne une command_line de 134 073 caractères) ça passe encore mais dès 1441 fichiers le job renvoie l'erreur du "argument list too long".
@team.galaxy une idée de s'il y a moyen de passer outre cette limite ? De mon côté je ne manipule habituellement que des dataset collection jusqu'à 1200-1300 fichiers, donc je n'avais jamais rencontré cette limite.