Bonjour!
J'aurais besoin d'aide pour optimiser des runs BEAST v1.10.4
J'ai récemment eu accès à la partition gpu, j'ai donc lancé un petit test :
#!/bin/bash
################################ Slurm options #################################
### Job name
#SBATCH --job-name=W148_strict_300_gpu-test
### Account
#SBATCH --account=mtb_central_asia
### Requirements
#SBATCH --partition=gpu
#SBATCH --gres=gpu:1g.5gb:1
#SBATCH --cpus-per-task=10
#SBATCH --mem=50G
### Time limit
#SBATCH --time=00:05:00
#Load modules
module load beast/1.10.4
module load beagle-lib/3.1.2
# Run
beast -beagle_GPU -overwrite
Cependant, dans mon fichier out, je n'ai pas l'impression que les ressources GPU aient été utilisés?
Using BEAGLE DataLikelihood Delegate
Using BEAGLE resource 0: CPU
Je suis aussi à la recherche de conseils sur l'optimisation des ressources, notamment en multithreading et en noeuds pour accélérer les temps de calcul sur logiciel.
Merci beaucoup,
Emilie