Bonjour,
le pipeline FROGS, dans sa dernière version, propose l'utilisation de Picrust2. Par contre la première étape (Step_1) ne peut pas être démarré car il semble manquer les éléments taxonomy marker pour lancer l'analyse.
S'agit-il d'un bug ou une subtilité m'a échappé?
Merci de votre aide.
Cédric
Bonjour Cédric,
Merci d'utiliser FROGSFunc.
Nous sommes en train de valider l'installation de cette nouvelle version sur le cluster de l'IFB et effectivement il manque la gestion de certaines informations. Nous sommes en contact avec les admin pour résoudre ces points (Banque PhiX et Chloroplaste non disponible dans FROGS).
Bonne continuation
Maria Bernard
cf : Banque PhiX et Chloroplaste non disponible dans FROGS
Les fichiers .loc n'avaient pas été correctement renseignés dans la conf galaxy.
C'est maintenant chose faite [Prod] : add frogs*.loc & change columns in tool_data_table_conf_local.xml (!574) · Merge requests · Institut Français de Bioinformatique / usegalaxy.fr / infrastructure · GitLab
Bonne journée
Thomas