Hello,
Pour ma première utilisation du cluster de l'IFB, je me suis également frotté pour la première fois à l'utilisation de Nextflow / Singularity.
J'ai suivi les reco de l'IFB pour le chargement des modules nextflow, singularity et openjdk sans précisé la version.
Ce que je comprends c'est que cela permet de charger la dernière version dispo. C'est bien ça?
Petite remarque simplement pour singularity, le chargement du module sans version (qui est par ailleurs remonté par module avail
contrairement à nextflow ou openjdk) est plus à jour que les modules dispo avec version.
- Pour singularity (en train de se renommer apptainer si j'ai bien compris)
mbernard@cpu-node-36:~$ module avail singularity
-------------------------------------------------------------- /shared/software/modulefiles ---------------------------------------------------------------
singularity
mbernard@cpu-node-36:~$
mbernard@cpu-node-36:~$ module load singularity
mbernard@cpu-node-36:~$ singularity --version
apptainer version 1.4.0
mbernard@cpu-node-36:~$
mbernard@cpu-node-36:~$ module avail apptainer
-------------------------------------------------------------- /shared/software/modulefiles ---------------------------------------------------------------
apptainer/1.3.6
mbernard@cpu-node-36:~$
Votre recommandation serait de charger les modules sans version et de tracer ensuite la version chargée?
Bonne journée
Maria