Bonjour,
En effectuant le tutoriel Mass spectrometry: LC-MS preprocessing with XCMS du GTN, j'ai rencontré un problème sur la mise en collection des fichiers mzML. En effet, ceux-ci sont possèdent des noms qui sont transformés en "Unnamed dataset" une fois à l'intérieur de la collection. Que cela soit fait directement via la fonction "Upload Data > Collection > Start > Build" ou en important directement les fichiers puis en les mettant sous forme de collection manuellement via "Pour toute la selection > Build Dataset List". De plus, il est impossible de les renommer manuellement une fois dans la collection. Il est alors impossible de tracer des chromatographes, les metadatas étant liés à la dénomination des fichiers mzML.
Ci-joint le lien du workflow en question: https://usegalaxy.fr/u/quentin_ruin/h/xcms-tutorial
Respectueusement,
Quentin Ruin