Bonjour,
j'aurais besoin de R version 3.5. Question d'un débutant, comment peux-je définir cette version de R dans mon RStudio du cluster ?
Merci par avance 
Viviana
Bonjour @Viviana,
Il n'est pas possible de changer de version de R sous notre RStudio IFB.
Nous exploitons la version gratuite de RStudio et seule la version pro le permet. Le coût est malheureusement prohibitif.
En ligne de commande, nous proposons néanmoins plusieurs versions de R en parallèle.
Par curiosité, pourquoi avec vous besoin de la 3.5 ? D'une manière générale, j'avais pour idée que R avait une bonne rétrocompatibilité en terme de portage de Libraries.
Bonjour Gildas,
merci pour votre réponse.
Le R 3.5 est pour recreer un environnement d'analyse pour ChromVAR, en suivant les scripts proposées par Pinello lab sur github et qui accompagnent l'article de Chen et al 2019 "Assessment of computational methods for the analysis of single-cell ATAC-seq data.
Bonne journée
Viviana
Je suis désolé mais en effet vous pouvez accéder à R-3.5.1 via la ligne de commande
module load r/3.5.1
Ou considérer qu'il n'y est pas trop de changement majeur entre la version des packages présentés dans la publication et celle que je peux vous proposer sur RStudio.
L'alternative serait que vous installiez RStudio-desktop sur votre PC : https://rstudio.com/products/rstudio/download/ mais je ne sais pas si on peut changer la version de R ?
ping @team.r Quelqu'un sait si c'est possible ?
J'ai trouvé ça pour la proposition alternative, si elle est retenu.
A tout fin utile, j'ai écrit un petit tuto si vous avez besoin de migrer de RStudio à R :
https://ifb-elixirfr.gitlab.io/cluster/doc/r/