Bonjour,
j'aimerais compiler CHARMM avec CUDA. L'utilisation du module cudatoolkit/11.6.0 ne m'a pas permis de définir un certain nombre de variables d'environnement qui font défaut, bien que le PATH ait été correctement ajouté:
module load cudatoolkit/11.6.0
LD_LIBRARY_PATH=/shared/ifbstor1/software/miniconda/envs/cudatoolkit-11.6.0/lib:
Les variables d'environnement manquantes sont les suivantes:
CUDA_TOOLKIT_ROOT_DIR not found or specified
-- Could NOT find CUDA (missing: CUDA_TOOLKIT_ROOT_DIR CUDA_NVCC_EXECUTABLE CUDA_INCLUDE_DIRS CUDA_CUDART_LIBRARY)
Merci pour votre aide.
Bonne journée.
Bonjour,
Avez-vous lancé cette compilation sur un noeud GPU (pour avoir les drivers Nvidia, il faut être sur une machine équipée des GPU Nvidia) ?
re-bonjour,
désolé, je me suis trompé de fenêtre au moment de la configuration; j'ai pu configurer correctement sauf pour un test:
-- Performing Test CMAKE_HAVE_LIBC_PTHREAD
-- Performing Test CMAKE_HAVE_LIBC_PTHREAD - Failed
-- Looking for pthread_create in pthreads
-- Looking for pthread_create in pthreads - not found
-- Looking for pthread_create in pthread
-- Looking for pthread_create in pthread - found
-- Found Threads: TRUE
-- Found CUDA: /usr/local/cuda (found version "11.4")
-- OpenCL include dir found: /usr/local/cuda/include
-- OpenCL library found: /usr/local/cuda/lib64/libOpenCL.so
Bonjour,
j'ai réussi à compiler et le binaire est executable. Merci.