Bonjour
En tentant de lancer un assemblage avec wtdbg2 et des paramètres spécifiques, le job ne se lance pas du tout indiquant "parameter 'input_reads': the previously selected dataset has been deleted". Seulement les données (ONT.fastq.gz) sont toujours présente (ni supprimées ni cachées), j'ai pu lancer Flye d'ailleurs sans problème. Pouvez vous m'aider à comprendre ce qui se passe svp ?
Merci
Salut Haoues !
Tu peux me partager ton historique pour que je regarde ça ? (mon compte = anthony.bretaudeau@irisa.fr)
Anthony
Voilà c'est partagé.
Merci
Salut,
Je crois comprendre : ton dataset ont est compressé (fastq.gz), mais wtdbg2 n'accepte que du fast décompressé.
Galaxy avait déjà fait une décompression automatique, mais le dataset correspondant a été supprimé (pour faire de la place sans doute). Et Galaxy refuse de faire une nouvelle décompression automatique.
Mais rien ne t'empêche de faire une conversion manuelle -> clic sur le petit crayon sur le dataset ONT -> Convert -> "... to uncompressed"
Ensuite wtdbg2 devrait accepter de prendre le nouveau dataset
Tiens moi au courant 
a+
Anthony
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ça tourne, tu as vu juste.
Merci beaucoup
Cool, bon assemblage !