Bonjour,
Dans le cadre d'un projet de recherche, j aurai besoin d'assembler des génomes complexes de plantes et mixtes (Illumina+long reads). Masurca fait le job (https://bioconda.github.io/recipes/maker/README.html). Depuis la version 3.3.0, il semble supporter SLURM.
Un grand merci
romain
[re] Bonjour
C'est en cours d'installation : masurca-3.3.4 (!167) · Merge requests · Institut Français de Bioinformatique / Cluster / conda-env · GitLab
C'est une bonne nouvelle car en effet, Masurca a tendance à prendre ses aises sur les clusters (problème rencontré avec SGE). Si ça ne vous dérange pas, monitorer les premiers runs pour voir si il n'y a pas d'effet inattendu.
Merci d'avance
Masurca est maintenant disponible :
module load masurca/3.3.4
Bonne analyse