Bonjour,
Dans le cadre du projet cd58_tm_fibroblast_analysis, j'aimerai savoir si il est possible d'accéder à la partition "bigmem".
J'ai effectué quelques test jusqu'ici, mais chaque analyse que j'ai pu lancer avec les partitions fast/long ont été stoppées à cause d'un manque de mémoire RAM.
En vous remerciant,
Emilien Laloy
Bonjour,
C'est fait. N'oubliez pas de spécifier la partition (--partition=bigmem) et votre compte (--account=<votre-projet>)..
Pensez à vérifier le bon usage des ressources: https://ifb-elixirfr.gitlab.io/cluster/doc/slurm/slurm_efficiency/.
Bonne journée
@dbenaben
Bonjour,
Je me permet de revenir ici car je pense que j'ai rencontré un problème.
Suite à votre intervention, j'ai pu obtenir accès à la partition bigmem (en précisant ou non le compte, puisque j'ai changé mon compte par défaut)
Cependant, je n'arrive pas à demander plus de 1500G de RAM pour lancer un job (ce qui, finalement, correspond aux partitions fast et long). Dès que je dépasse le seuil, le job ne se lance pas (NODELIST(REASON) (QOSMaxMemoryPerUser))
J'ai lu sur la notice qu'il était possible de demander jusqu'à 4000G de RAM pour la partition bigmem.
Est-ce que j'ai oublié une étape quelque part ?
En vous remerciant et en vous souhaitant de bonne fêtes,
Emilien Laloy
En effet. En attendant qu'on règle l'anomalie, vous devez sépcifier -q bigmem (au moment de lancer le job ou dans votre script: #SBATCH --qos bigmem)
bigmem était également bloqué. La machine est de nouveau accessible.
Bonne continuation