Bonjour,
Pour une analyse, j'ai dû télécharger l'une des bases de données de Foldseek (Alphafold/Uniref50) ce qui m'a fait dépasser le quota d'espace sur ce projet (utilisateur : hvaysset ; account : mdm_db_coli). Serait-il possible d'obtenir environ 300Go de stockage supplémentaire pour ce projet ?
Au passage, je me demandais s'il était envisageable d'ajouter aux banques de données communes du cluster (/shared/bank) quelques une des databases Foldseek (e.g. PDB, Alphafold/Uniprot et pourquoi pas Alphafold/Proteome). Je pense que cela pourrait être utile à plusieurs utilisateurs du cluster et cela éviterait ces databases soient stockées de manière indépendante à plusieurs endroits.
Merci beaucoup et bonne journée!
Bonjour,
Le projet mdm_db_coli a encore un peu d'espace (470Go), n'est-ce pas plutôt le projet mdm_db_computations ?
Je me demandais s'il était envisageable d'ajouter aux banques de données communes du cluster (/shared/bank) quelques une des databases Foldseek (e.g. PDB, Alphafold/Uniprot et pourquoi pas Alphafold/Proteome)
Oui c'est possible. Accepteriez-vous de participer à la gestion de ces banques de données (au moins pour cette partie) ?
Nous n'avons pas encore automatisé la gestion de ces banques. Tout ça est encore assez manuel.
On pourrait alors vous donner la possibilité de modifier les banques en place sur l'IFB (/shared/bank) et aussi vous intégrer à la @team.bank (vous serez alors potentiellement notifié pour aider à l'installation ou la mise à jour de banque).
Quelques précisions sur notre fonctionnement: Banques de données /shared/bank - #2 par dbenaben
Bonjour,
Merci pour votre réponse, je me suis débrouillé autrement pour l'espace de stockage donc j'ai enlevé la base foldseek que j'avais commencé à installer sur mdm_db_coli.
Je vous envoie un MP pour avoir plus de précisions sur l'installation des bases foldseek dans /shared/bank