Demande d'installation de DeepTMHMM

IFB Core Cluster Demande de logiciel ou de banque de données
1

Bonjour @team.software,

Je voudrais installer deepTHMM (https://dtu.biolib.com/DeepTMHMM) afin de faire de la prediction de localisation de protéine.
GitHub - cbligaard/DeepTM: DeepTM: A deep learning setup for prediction of transmembrane proteins
Seriez vous ok d'installer l'outil sur le cluster ?

merci beaucoup par avance

Chloé

2

Bonjour Chloé,

Nos excuses pour ce retour tardif.

DeepTM (GitHub - cbligaard/DeepTM: DeepTM: A deep learning setup for prediction of transmembrane proteins) ne semble pas fournir de documentation d'installation ou d'usage.
C'est un simple dépôt de scripts python. Avez-vous essayer de les utiliser ?

Pour deepTMHMM via biolib, je ne vois pas comment faire (cf: Demande d'installation : DeepTMHMM - #2 par dbenaben).

N'hésitez-pas si vous avez des précisions à nous apporter.

Bonne fin de journée