Bonjour,
Je souhaiterai utiliser la dernière version d'un outil qui à été développé récemment permettant de faire de la prédiction de domaines transmembranaires de protéines.
Serait-il possible de l'installer sur le cluster ? https://dtu.biolib.com/DeepTMHMM
Cordialement,
Théo Durand
Bonjour Théo,
Désolé pour ce retour tardif.
DeepTMHMM s’exécute via biolib.
Leur application ne semble pas utilisable sans (en tout cas, je ne trouve pas d'info).
Et par défaut, cela s'exécute dans le "BioLib Cloud" (une entreprise danoise privée).
Pour le faire tourner localement sur son poste de travail, cela semble possible (via docker) mais je ne trouve pas de moyen de la faire tourner sur le cluster.
Il semble possible d'utiliser singularity (via des images docker convertit) sur le cluster malheureusement je ne trouve aucune documentation complémentaire. Impossible d'aller plus loin pour moi.
Dites-nous si vous avez des éclaircissements à nous apporter.
Bonne fin de journée