Demande d'installation gubbins, IQtree, Rapidnj @team.software

[ewicker]

Bonjour,

Pour des analyses de recombinaison dans des génomes procaryotes et eucaryotes, pouvez-vous installer les logiciels suivants ?

• gubbins : GitHub - nickjcroucher/gubbins: Rapid phylogenetic analysis of large samples of recombinant bacterial whole genome sequences using Gubbins
• IQtree : IQ-TREE: Efficient phylogenomic software by maximum likelihood
  -rapidnj: GitHub - johnlees/rapidnj: Code for rapidNJ by Martin Simonsen, Thomas Mailund and Christian N. S. Pedersen.

Merci d'avance,
Emmanuel

[lgueguen]

Bonjour, les outils sont en cours d'installation:

• Add rapidnj/2.3.2 (!771) · Merge requests · Institut Français de Bioinformatique / Cluster / tools · GitLab
• Add iqtree 2.2.0_beta (!770) · Merge requests · Institut Français de Bioinformatique / Cluster / tools · GitLab
• Add gubbins/3.2.0 (!772) · Merge requests · Institut Français de Bioinformatique / Cluster / tools · GitLab

iqtree est déjà disponible dans une version postérieure: 2.0.3

Loraine

[lgueguen]

Les outils sont installés. Bonne journée. Loraine